Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAPN6Q9Y6Q1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPN6Q9Y6Q1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPN6Q9Y6Q1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPN6Q9Y6Q1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPN6Q9Y6Q1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPN6Q9Y6Q1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPN6Q9Y6Q1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPN6Q9Y6Q1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAPN6Q9Y6Q1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPN6Q9Y6Q1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPN6Q9Y6Q1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAPN6Q9Y6Q1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPN6Q9Y6Q1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPN6Q9Y6Q1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPN6Q9Y6Q1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPN6Q9Y6Q1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPN6Q9Y6Q1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPN6Q9Y6Q1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAPN6Q9Y6Q1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPN6Q9Y6Q1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPN6Q9Y6Q1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPN6Q9Y6Q1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPN6Q9Y6Q1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPN6Q9Y6Q1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPN6Q9Y6Q1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPN6Q9Y6Q1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPN6Q9Y6Q1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPN6Q9Y6Q1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPN6Q9Y6Q1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPN6Q9Y6Q1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPN6Q9Y6Q1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPN6Q9Y6Q1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPN6Q9Y6Q1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPN6Q9Y6Q1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPN6Q9Y6Q1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPN6Q9Y6Q1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPN6Q9Y6Q1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAPN6Q9Y6Q1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPN6Q9Y6Q1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPN6Q9Y6Q1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPN6Q9Y6Q1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPN6Q9Y6Q1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPN6Q9Y6Q1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAPN6Q9Y6Q1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN6Q9Y6Q1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CAPN6Q9Y6Q1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPN6Q9Y6Q1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPN6Q9Y6Q1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPN6Q9Y6Q1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPN6Q9Y6Q1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPN6Q9Y6Q1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPN6Q9Y6Q1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAPN6Q9Y6Q1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPN6Q9Y6Q1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPN6Q9Y6Q1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPN6Q9Y6Q1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPN6Q9Y6Q1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPN6Q9Y6Q1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPN6Q9Y6Q1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPN6Q9Y6Q1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPN6Q9Y6Q1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPN6Q9Y6Q1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPN6Q9Y6Q1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPN6Q9Y6Q1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPN6Q9Y6Q1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPN6Q9Y6Q1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN6Q9Y6Q1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN6Q9Y6Q1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN6Q9Y6Q1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN6Q9Y6Q1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN6Q9Y6Q1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN6Q9Y6Q1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN6Q9Y6Q1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPN6Q9Y6Q1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPN6Q9Y6Q1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPN6Q9Y6Q1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPN6Q9Y6Q1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPN6Q9Y6Q1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPN6Q9Y6Q1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPN6Q9Y6Q1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPN6Q9Y6Q1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPN6Q9Y6Q1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPN6Q9Y6Q1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPN6Q9Y6Q1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPN6Q9Y6Q1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPN6Q9Y6Q1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPN6Q9Y6Q1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN6Q9Y6Q1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN6Q9Y6Q1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN6Q9Y6Q1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN6Q9Y6Q1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN6Q9Y6Q1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN6Q9Y6Q1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPN6Q9Y6Q1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
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