Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q8

GTF3C5, General transcription factor 3C polypeptide 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C5Q9Y5Q8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF3C5Q9Y5Q8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF3C5Q9Y5Q8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF3C5Q9Y5Q8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF3C5Q9Y5Q8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF3C5Q9Y5Q8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF3C5Q9Y5Q8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF3C5Q9Y5Q8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF3C5Q9Y5Q8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF3C5Q9Y5Q8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF3C5Q9Y5Q8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF3C5Q9Y5Q8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF3C5Q9Y5Q8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF3C5Q9Y5Q8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF3C5Q9Y5Q8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF3C5Q9Y5Q8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF3C5Q9Y5Q8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF3C5Q9Y5Q8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF3C5Q9Y5Q8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF3C5Q9Y5Q8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF3C5Q9Y5Q8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF3C5Q9Y5Q8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF3C5Q9Y5Q8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF3C5Q9Y5Q8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF3C5Q9Y5Q8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF3C5Q9Y5Q8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF3C5Q9Y5Q8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF3C5Q9Y5Q8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF3C5Q9Y5Q8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF3C5Q9Y5Q8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF3C5Q9Y5Q8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF3C5Q9Y5Q8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF3C5Q9Y5Q8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF3C5Q9Y5Q8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF3C5Q9Y5Q8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF3C5Q9Y5Q8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GTF3C5Q9Y5Q8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
GTF3C5Q9Y5Q8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GTF3C5Q9Y5Q8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF3C5Q9Y5Q8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF3C5Q9Y5Q8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF3C5Q9Y5Q8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF3C5Q9Y5Q8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF3C5Q9Y5Q8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF3C5Q9Y5Q8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF3C5Q9Y5Q8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF3C5Q9Y5Q8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF3C5Q9Y5Q8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF3C5Q9Y5Q8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF3C5Q9Y5Q8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF3C5Q9Y5Q8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF3C5Q9Y5Q8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF3C5Q9Y5Q8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF3C5Q9Y5Q8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF3C5Q9Y5Q8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF3C5Q9Y5Q8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GTF3C5Q9Y5Q8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GTF3C5Q9Y5Q8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF3C5Q9Y5Q8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF3C5Q9Y5Q8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF3C5Q9Y5Q8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF3C5Q9Y5Q8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF3C5Q9Y5Q8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF3C5Q9Y5Q8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF3C5Q9Y5Q8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF3C5Q9Y5Q8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF3C5Q9Y5Q8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF3C5Q9Y5Q8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF3C5Q9Y5Q8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF3C5Q9Y5Q8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF3C5Q9Y5Q8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF3C5Q9Y5Q8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF3C5Q9Y5Q8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF3C5Q9Y5Q8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF3C5Q9Y5Q8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF3C5Q9Y5Q8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF3C5Q9Y5Q8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF3C5Q9Y5Q8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF3C5Q9Y5Q8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF3C5Q9Y5Q8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF3C5Q9Y5Q8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF3C5Q9Y5Q8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF3C5Q9Y5Q8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF3C5Q9Y5Q8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF3C5Q9Y5Q8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF3C5Q9Y5Q8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF3C5Q9Y5Q8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF3C5Q9Y5Q8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF3C5Q9Y5Q8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF3C5Q9Y5Q8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF3C5Q9Y5Q8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF3C5Q9Y5Q8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF3C5Q9Y5Q8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF3C5Q9Y5Q8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF3C5Q9Y5Q8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF3C5Q9Y5Q8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF3C5Q9Y5Q8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF3C5Q9Y5Q8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF3C5Q9Y5Q8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GTF3C5Q9Y5Q8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 227.9 ms