Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PAXBP1Q9Y5B6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PAXBP1Q9Y5B6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PAXBP1Q9Y5B6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PAXBP1Q9Y5B6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PAXBP1Q9Y5B6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PAXBP1Q9Y5B6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PAXBP1Q9Y5B6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PAXBP1Q9Y5B6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PAXBP1Q9Y5B6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PAXBP1Q9Y5B6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PAXBP1Q9Y5B6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PAXBP1Q9Y5B6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PAXBP1Q9Y5B6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PAXBP1Q9Y5B6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PAXBP1Q9Y5B6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PAXBP1Q9Y5B6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PAXBP1Q9Y5B6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PAXBP1Q9Y5B6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PAXBP1Q9Y5B6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PAXBP1Q9Y5B6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PAXBP1Q9Y5B6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PAXBP1Q9Y5B6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PAXBP1Q9Y5B6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PAXBP1Q9Y5B6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PAXBP1Q9Y5B6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PAXBP1Q9Y5B6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PAXBP1Q9Y5B6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PAXBP1Q9Y5B6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PAXBP1Q9Y5B6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PAXBP1Q9Y5B6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PAXBP1Q9Y5B6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PAXBP1Q9Y5B6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PAXBP1Q9Y5B6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PAXBP1Q9Y5B6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PAXBP1Q9Y5B6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAXBP1Q9Y5B6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAXBP1Q9Y5B6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAXBP1Q9Y5B6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAXBP1Q9Y5B6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PAXBP1Q9Y5B6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PAXBP1Q9Y5B6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PAXBP1Q9Y5B6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PAXBP1Q9Y5B6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PAXBP1Q9Y5B6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PAXBP1Q9Y5B6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PAXBP1Q9Y5B6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
PAXBP1Q9Y5B6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PAXBP1Q9Y5B6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PAXBP1Q9Y5B6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PAXBP1Q9Y5B6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PAXBP1Q9Y5B6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PAXBP1Q9Y5B6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PAXBP1Q9Y5B6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PAXBP1Q9Y5B6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PAXBP1Q9Y5B6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PAXBP1Q9Y5B6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PAXBP1Q9Y5B6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PAXBP1Q9Y5B6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PAXBP1Q9Y5B6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PAXBP1Q9Y5B6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PAXBP1Q9Y5B6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAXBP1Q9Y5B6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAXBP1Q9Y5B6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAXBP1Q9Y5B6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAXBP1Q9Y5B6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAXBP1Q9Y5B6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAXBP1Q9Y5B6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAXBP1Q9Y5B6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PAXBP1Q9Y5B6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PAXBP1Q9Y5B6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PAXBP1Q9Y5B6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PAXBP1Q9Y5B6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PAXBP1Q9Y5B6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PAXBP1Q9Y5B6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PAXBP1Q9Y5B6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PAXBP1Q9Y5B6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PAXBP1Q9Y5B6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PAXBP1Q9Y5B6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PAXBP1Q9Y5B6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PAXBP1Q9Y5B6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PAXBP1Q9Y5B6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PAXBP1Q9Y5B6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PAXBP1Q9Y5B6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PAXBP1Q9Y5B6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PAXBP1Q9Y5B6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PAXBP1Q9Y5B6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PAXBP1Q9Y5B6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PAXBP1Q9Y5B6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PAXBP1Q9Y5B6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PAXBP1Q9Y5B6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PAXBP1Q9Y5B6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PAXBP1Q9Y5B6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PAXBP1Q9Y5B6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PAXBP1Q9Y5B6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PAXBP1Q9Y5B6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PAXBP1Q9Y5B6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms