Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR6

ZFR2, Zinc finger RNA-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFR2Q9UPR6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZFR2Q9UPR6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZFR2Q9UPR6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZFR2Q9UPR6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZFR2Q9UPR6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZFR2Q9UPR6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZFR2Q9UPR6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZFR2Q9UPR6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZFR2Q9UPR6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZFR2Q9UPR6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZFR2Q9UPR6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZFR2Q9UPR6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZFR2Q9UPR6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZFR2Q9UPR6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZFR2Q9UPR6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZFR2Q9UPR6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZFR2Q9UPR6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZFR2Q9UPR6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZFR2Q9UPR6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZFR2Q9UPR6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZFR2Q9UPR6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZFR2Q9UPR6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZFR2Q9UPR6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZFR2Q9UPR6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZFR2Q9UPR6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZFR2Q9UPR6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZFR2Q9UPR6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZFR2Q9UPR6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZFR2Q9UPR6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ZFR2Q9UPR6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZFR2Q9UPR6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZFR2Q9UPR6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZFR2Q9UPR6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZFR2Q9UPR6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZFR2Q9UPR6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZFR2Q9UPR6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZFR2Q9UPR6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZFR2Q9UPR6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ZFR2Q9UPR6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZFR2Q9UPR6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZFR2Q9UPR6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZFR2Q9UPR6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZFR2Q9UPR6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZFR2Q9UPR6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ZFR2Q9UPR6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZFR2Q9UPR6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZFR2Q9UPR6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZFR2Q9UPR6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZFR2Q9UPR6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZFR2Q9UPR6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZFR2Q9UPR6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZFR2Q9UPR6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZFR2Q9UPR6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZFR2Q9UPR6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZFR2Q9UPR6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZFR2Q9UPR6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZFR2Q9UPR6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZFR2Q9UPR6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZFR2Q9UPR6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZFR2Q9UPR6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZFR2Q9UPR6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ZFR2Q9UPR6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZFR2Q9UPR6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZFR2Q9UPR6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ZFR2Q9UPR6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZFR2Q9UPR6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZFR2Q9UPR6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZFR2Q9UPR6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZFR2Q9UPR6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZFR2Q9UPR6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZFR2Q9UPR6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZFR2Q9UPR6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZFR2Q9UPR6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZFR2Q9UPR6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ZFR2Q9UPR6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZFR2Q9UPR6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ZFR2Q9UPR6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZFR2Q9UPR6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZFR2Q9UPR6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZFR2Q9UPR6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZFR2Q9UPR6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZFR2Q9UPR6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZFR2Q9UPR6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ZFR2Q9UPR6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZFR2Q9UPR6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZFR2Q9UPR6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZFR2Q9UPR6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZFR2Q9UPR6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZFR2Q9UPR6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZFR2Q9UPR6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZFR2Q9UPR6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZFR2Q9UPR6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZFR2Q9UPR6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZFR2Q9UPR6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZFR2Q9UPR6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZFR2Q9UPR6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZFR2Q9UPR6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZFR2Q9UPR6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZFR2Q9UPR6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZFR2Q9UPR6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms