Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKZ1

CNOT11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT11Q9UKZ1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CNOT11Q9UKZ1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNOT11Q9UKZ1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNOT11Q9UKZ1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNOT11Q9UKZ1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNOT11Q9UKZ1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNOT11Q9UKZ1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNOT11Q9UKZ1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNOT11Q9UKZ1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNOT11Q9UKZ1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNOT11Q9UKZ1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNOT11Q9UKZ1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNOT11Q9UKZ1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNOT11Q9UKZ1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNOT11Q9UKZ1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNOT11Q9UKZ1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CNOT11Q9UKZ1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNOT11Q9UKZ1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNOT11Q9UKZ1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CNOT11Q9UKZ1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNOT11Q9UKZ1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNOT11Q9UKZ1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNOT11Q9UKZ1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNOT11Q9UKZ1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNOT11Q9UKZ1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNOT11Q9UKZ1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNOT11Q9UKZ1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNOT11Q9UKZ1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CNOT11Q9UKZ1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNOT11Q9UKZ1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNOT11Q9UKZ1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNOT11Q9UKZ1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNOT11Q9UKZ1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNOT11Q9UKZ1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNOT11Q9UKZ1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNOT11Q9UKZ1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNOT11Q9UKZ1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNOT11Q9UKZ1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNOT11Q9UKZ1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNOT11Q9UKZ1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNOT11Q9UKZ1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNOT11Q9UKZ1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CNOT11Q9UKZ1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNOT11Q9UKZ1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNOT11Q9UKZ1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNOT11Q9UKZ1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNOT11Q9UKZ1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNOT11Q9UKZ1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNOT11Q9UKZ1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNOT11Q9UKZ1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNOT11Q9UKZ1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNOT11Q9UKZ1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNOT11Q9UKZ1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNOT11Q9UKZ1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNOT11Q9UKZ1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNOT11Q9UKZ1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNOT11Q9UKZ1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNOT11Q9UKZ1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CNOT11Q9UKZ1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNOT11Q9UKZ1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNOT11Q9UKZ1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNOT11Q9UKZ1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CNOT11Q9UKZ1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNOT11Q9UKZ1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNOT11Q9UKZ1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNOT11Q9UKZ1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNOT11Q9UKZ1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNOT11Q9UKZ1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNOT11Q9UKZ1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNOT11Q9UKZ1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNOT11Q9UKZ1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNOT11Q9UKZ1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNOT11Q9UKZ1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNOT11Q9UKZ1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNOT11Q9UKZ1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CNOT11Q9UKZ1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNOT11Q9UKZ1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNOT11Q9UKZ1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNOT11Q9UKZ1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNOT11Q9UKZ1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CNOT11Q9UKZ1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNOT11Q9UKZ1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNOT11Q9UKZ1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNOT11Q9UKZ1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNOT11Q9UKZ1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNOT11Q9UKZ1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNOT11Q9UKZ1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNOT11Q9UKZ1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNOT11Q9UKZ1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNOT11Q9UKZ1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNOT11Q9UKZ1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNOT11Q9UKZ1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNOT11Q9UKZ1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNOT11Q9UKZ1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CNOT11Q9UKZ1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNOT11Q9UKZ1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNOT11Q9UKZ1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNOT11Q9UKZ1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNOT11Q9UKZ1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNOT11Q9UKZ1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms