Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ7

SCP2D1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2D1Q9UJQ7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCP2D1Q9UJQ7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCP2D1Q9UJQ7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCP2D1Q9UJQ7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms