Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
NPC1L1Q9UHC9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NPC1L1Q9UHC9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
NPC1L1Q9UHC9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NPC1L1Q9UHC9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NPC1L1Q9UHC9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
NPC1L1Q9UHC9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NPC1L1Q9UHC9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NPC1L1Q9UHC9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NPC1L1Q9UHC9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
NPC1L1Q9UHC9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
NPC1L1Q9UHC9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NPC1L1Q9UHC9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
NPC1L1Q9UHC9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
NPC1L1Q9UHC9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
NPC1L1Q9UHC9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.86
NPC1L1Q9UHC9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC32.95■■■□□ 2.86
NPC1L1Q9UHC9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NPC1L1Q9UHC9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NPC1L1Q9UHC9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
NPC1L1Q9UHC9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC32.94■■■□□ 2.86
NPC1L1Q9UHC9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NPC1L1Q9UHC9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NPC1L1Q9UHC9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NPC1L1Q9UHC9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NPC1L1Q9UHC9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NPC1L1Q9UHC9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NPC1L1Q9UHC9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
NPC1L1Q9UHC9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NPC1L1Q9UHC9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NPC1L1Q9UHC9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
NPC1L1Q9UHC9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
NPC1L1Q9UHC9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
NPC1L1Q9UHC9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
NPC1L1Q9UHC9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NPC1L1Q9UHC9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NPC1L1Q9UHC9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
NPC1L1Q9UHC9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NPC1L1Q9UHC9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NPC1L1Q9UHC9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
NPC1L1Q9UHC9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NPC1L1Q9UHC9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NPC1L1Q9UHC9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
NPC1L1Q9UHC9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
NPC1L1Q9UHC9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NPC1L1Q9UHC9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
NPC1L1Q9UHC9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
NPC1L1Q9UHC9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
NPC1L1Q9UHC9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
NPC1L1Q9UHC9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
NPC1L1Q9UHC9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
NPC1L1Q9UHC9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
NPC1L1Q9UHC9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
NPC1L1Q9UHC9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
NPC1L1Q9UHC9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
NPC1L1Q9UHC9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
NPC1L1Q9UHC9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
NPC1L1Q9UHC9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
NPC1L1Q9UHC9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
NPC1L1Q9UHC9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
NPC1L1Q9UHC9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
NPC1L1Q9UHC9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
NPC1L1Q9UHC9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
NPC1L1Q9UHC9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
NPC1L1Q9UHC9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
NPC1L1Q9UHC9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
NPC1L1Q9UHC9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NPC1L1Q9UHC9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
NPC1L1Q9UHC9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
NPC1L1Q9UHC9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
NPC1L1Q9UHC9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
NPC1L1Q9UHC9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
NPC1L1Q9UHC9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
NPC1L1Q9UHC9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NPC1L1Q9UHC9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NPC1L1Q9UHC9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NPC1L1Q9UHC9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
NPC1L1Q9UHC9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
NPC1L1Q9UHC9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
NPC1L1Q9UHC9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NPC1L1Q9UHC9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NPC1L1Q9UHC9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NPC1L1Q9UHC9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NPC1L1Q9UHC9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NPC1L1Q9UHC9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NPC1L1Q9UHC9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NPC1L1Q9UHC9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
NPC1L1Q9UHC9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NPC1L1Q9UHC9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
NPC1L1Q9UHC9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NPC1L1Q9UHC9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
NPC1L1Q9UHC9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NPC1L1Q9UHC9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
NPC1L1Q9UHC9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NPC1L1Q9UHC9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NPC1L1Q9UHC9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
NPC1L1Q9UHC9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
NPC1L1Q9UHC9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NPC1L1Q9UHC9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NPC1L1Q9UHC9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms