Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K3

RCOR3, REST corepressor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCOR3Q9P2K3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RCOR3Q9P2K3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RCOR3Q9P2K3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RCOR3Q9P2K3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RCOR3Q9P2K3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RCOR3Q9P2K3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCOR3Q9P2K3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCOR3Q9P2K3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCOR3Q9P2K3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCOR3Q9P2K3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCOR3Q9P2K3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCOR3Q9P2K3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCOR3Q9P2K3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCOR3Q9P2K3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCOR3Q9P2K3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCOR3Q9P2K3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RCOR3Q9P2K3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RCOR3Q9P2K3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCOR3Q9P2K3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCOR3Q9P2K3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RCOR3Q9P2K3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RCOR3Q9P2K3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RCOR3Q9P2K3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCOR3Q9P2K3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCOR3Q9P2K3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RCOR3Q9P2K3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCOR3Q9P2K3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCOR3Q9P2K3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RCOR3Q9P2K3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCOR3Q9P2K3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RCOR3Q9P2K3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RCOR3Q9P2K3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RCOR3Q9P2K3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RCOR3Q9P2K3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RCOR3Q9P2K3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RCOR3Q9P2K3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RCOR3Q9P2K3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RCOR3Q9P2K3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RCOR3Q9P2K3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RCOR3Q9P2K3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCOR3Q9P2K3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCOR3Q9P2K3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCOR3Q9P2K3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RCOR3Q9P2K3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RCOR3Q9P2K3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RCOR3Q9P2K3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RCOR3Q9P2K3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RCOR3Q9P2K3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RCOR3Q9P2K3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RCOR3Q9P2K3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RCOR3Q9P2K3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RCOR3Q9P2K3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RCOR3Q9P2K3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RCOR3Q9P2K3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RCOR3Q9P2K3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RCOR3Q9P2K3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RCOR3Q9P2K3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RCOR3Q9P2K3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RCOR3Q9P2K3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RCOR3Q9P2K3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RCOR3Q9P2K3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RCOR3Q9P2K3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RCOR3Q9P2K3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RCOR3Q9P2K3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RCOR3Q9P2K3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RCOR3Q9P2K3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RCOR3Q9P2K3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RCOR3Q9P2K3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RCOR3Q9P2K3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RCOR3Q9P2K3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RCOR3Q9P2K3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RCOR3Q9P2K3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RCOR3Q9P2K3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RCOR3Q9P2K3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RCOR3Q9P2K3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RCOR3Q9P2K3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RCOR3Q9P2K3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RCOR3Q9P2K3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RCOR3Q9P2K3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RCOR3Q9P2K3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RCOR3Q9P2K3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RCOR3Q9P2K3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCOR3Q9P2K3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCOR3Q9P2K3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCOR3Q9P2K3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCOR3Q9P2K3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCOR3Q9P2K3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCOR3Q9P2K3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RCOR3Q9P2K3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCOR3Q9P2K3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCOR3Q9P2K3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RCOR3Q9P2K3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RCOR3Q9P2K3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RCOR3Q9P2K3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RCOR3Q9P2K3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RCOR3Q9P2K3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RCOR3Q9P2K3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RCOR3Q9P2K3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RCOR3Q9P2K3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RCOR3Q9P2K3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms