Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
CC2D2AQ9P2K1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
CC2D2AQ9P2K1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC44.9■■■■■ 4.78
CC2D2AQ9P2K1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
CC2D2AQ9P2K1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
CC2D2AQ9P2K1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
CC2D2AQ9P2K1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC44.89■■■■■ 4.78
CC2D2AQ9P2K1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC44.89■■■■■ 4.78
CC2D2AQ9P2K1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC44.88■■■■■ 4.78
CC2D2AQ9P2K1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC44.88■■■■■ 4.78
CC2D2AQ9P2K1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.77
CC2D2AQ9P2K1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.77
CC2D2AQ9P2K1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC44.87■■■■■ 4.77
CC2D2AQ9P2K1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC44.87■■■■■ 4.77
CC2D2AQ9P2K1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
CC2D2AQ9P2K1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC44.86■■■■■ 4.77
CC2D2AQ9P2K1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC44.86■■■■■ 4.77
CC2D2AQ9P2K1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
CC2D2AQ9P2K1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC44.85■■■■■ 4.77
CC2D2AQ9P2K1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
CC2D2AQ9P2K1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
CC2D2AQ9P2K1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
CC2D2AQ9P2K1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.77
CC2D2AQ9P2K1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.77
CC2D2AQ9P2K1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.77
CC2D2AQ9P2K1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.82■■■■■ 4.77
CC2D2AQ9P2K1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.77
CC2D2AQ9P2K1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.77
CC2D2AQ9P2K1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC44.79■■■■■ 4.76
CC2D2AQ9P2K1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC44.79■■■■■ 4.76
CC2D2AQ9P2K1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC44.79■■■■■ 4.76
CC2D2AQ9P2K1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC44.79■■■■■ 4.76
CC2D2AQ9P2K1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
CC2D2AQ9P2K1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
CC2D2AQ9P2K1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC44.79■■■■■ 4.76
CC2D2AQ9P2K1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.79■■■■■ 4.76
CC2D2AQ9P2K1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
CC2D2AQ9P2K1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC44.78■■■■■ 4.76
CC2D2AQ9P2K1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
CC2D2AQ9P2K1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
CC2D2AQ9P2K1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
CC2D2AQ9P2K1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
CC2D2AQ9P2K1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC44.74■■■■■ 4.75
CC2D2AQ9P2K1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
CC2D2AQ9P2K1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC44.74■■■■■ 4.75
CC2D2AQ9P2K1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC44.74■■■■■ 4.75
CC2D2AQ9P2K1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
CC2D2AQ9P2K1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.73■■■■■ 4.75
CC2D2AQ9P2K1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.72■■■■■ 4.75
CC2D2AQ9P2K1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.72■■■■■ 4.75
CC2D2AQ9P2K1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC44.72■■■■■ 4.75
CC2D2AQ9P2K1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
CC2D2AQ9P2K1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC44.72■■■■■ 4.75
CC2D2AQ9P2K1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.71■■■■■ 4.75
CC2D2AQ9P2K1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
CC2D2AQ9P2K1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.71■■■■■ 4.75
CC2D2AQ9P2K1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
CC2D2AQ9P2K1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC44.7■■■■■ 4.75
CC2D2AQ9P2K1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
CC2D2AQ9P2K1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC44.69■■■■■ 4.74
CC2D2AQ9P2K1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC44.69■■■■■ 4.74
CC2D2AQ9P2K1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
CC2D2AQ9P2K1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC44.68■■■■■ 4.74
CC2D2AQ9P2K1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC44.68■■■■■ 4.74
CC2D2AQ9P2K1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC44.68■■■■■ 4.74
CC2D2AQ9P2K1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
CC2D2AQ9P2K1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
CC2D2AQ9P2K1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
CC2D2AQ9P2K1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
CC2D2AQ9P2K1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC44.67■■■■■ 4.74
CC2D2AQ9P2K1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
CC2D2AQ9P2K1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
CC2D2AQ9P2K1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC44.66■■■■■ 4.74
CC2D2AQ9P2K1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC44.66■■■■■ 4.74
CC2D2AQ9P2K1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC44.66■■■■■ 4.74
CC2D2AQ9P2K1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC44.66■■■■■ 4.74
CC2D2AQ9P2K1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
CC2D2AQ9P2K1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
CC2D2AQ9P2K1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC44.65■■■■■ 4.74
CC2D2AQ9P2K1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
CC2D2AQ9P2K1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC44.64■■■■■ 4.74
CC2D2AQ9P2K1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC44.64■■■■■ 4.74
CC2D2AQ9P2K1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC44.64■■■■■ 4.74
CC2D2AQ9P2K1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC44.64■■■■■ 4.74
CC2D2AQ9P2K1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.73
CC2D2AQ9P2K1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
CC2D2AQ9P2K1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.62■■■■■ 4.73
CC2D2AQ9P2K1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.61■■■■■ 4.73
CC2D2AQ9P2K1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC44.61■■■■■ 4.73
CC2D2AQ9P2K1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.61■■■■■ 4.73
CC2D2AQ9P2K1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
CC2D2AQ9P2K1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC44.61■■■■■ 4.73
CC2D2AQ9P2K1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC44.61■■■■■ 4.73
CC2D2AQ9P2K1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC44.6■■■■■ 4.73
CC2D2AQ9P2K1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
CC2D2AQ9P2K1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
CC2D2AQ9P2K1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC44.59■■■■■ 4.73
CC2D2AQ9P2K1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC44.58■■■■■ 4.73
CC2D2AQ9P2K1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC44.58■■■■■ 4.73
CC2D2AQ9P2K1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC44.57■■■■■ 4.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms