Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CHPF2Q9P2E5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CHPF2Q9P2E5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
CHPF2Q9P2E5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CHPF2Q9P2E5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CHPF2Q9P2E5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CHPF2Q9P2E5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CHPF2Q9P2E5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
CHPF2Q9P2E5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CHPF2Q9P2E5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CHPF2Q9P2E5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CHPF2Q9P2E5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CHPF2Q9P2E5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CHPF2Q9P2E5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CHPF2Q9P2E5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CHPF2Q9P2E5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CHPF2Q9P2E5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CHPF2Q9P2E5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CHPF2Q9P2E5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CHPF2Q9P2E5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CHPF2Q9P2E5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CHPF2Q9P2E5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CHPF2Q9P2E5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CHPF2Q9P2E5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CHPF2Q9P2E5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CHPF2Q9P2E5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CHPF2Q9P2E5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CHPF2Q9P2E5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CHPF2Q9P2E5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
CHPF2Q9P2E5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CHPF2Q9P2E5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CHPF2Q9P2E5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CHPF2Q9P2E5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CHPF2Q9P2E5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CHPF2Q9P2E5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CHPF2Q9P2E5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CHPF2Q9P2E5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CHPF2Q9P2E5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CHPF2Q9P2E5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CHPF2Q9P2E5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CHPF2Q9P2E5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CHPF2Q9P2E5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
CHPF2Q9P2E5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
CHPF2Q9P2E5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CHPF2Q9P2E5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CHPF2Q9P2E5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CHPF2Q9P2E5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CHPF2Q9P2E5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CHPF2Q9P2E5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CHPF2Q9P2E5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CHPF2Q9P2E5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CHPF2Q9P2E5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CHPF2Q9P2E5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CHPF2Q9P2E5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CHPF2Q9P2E5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
CHPF2Q9P2E5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
CHPF2Q9P2E5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CHPF2Q9P2E5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CHPF2Q9P2E5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CHPF2Q9P2E5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CHPF2Q9P2E5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHPF2Q9P2E5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHPF2Q9P2E5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHPF2Q9P2E5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CHPF2Q9P2E5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CHPF2Q9P2E5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
CHPF2Q9P2E5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CHPF2Q9P2E5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CHPF2Q9P2E5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CHPF2Q9P2E5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CHPF2Q9P2E5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CHPF2Q9P2E5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CHPF2Q9P2E5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CHPF2Q9P2E5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CHPF2Q9P2E5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CHPF2Q9P2E5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CHPF2Q9P2E5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CHPF2Q9P2E5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CHPF2Q9P2E5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CHPF2Q9P2E5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CHPF2Q9P2E5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CHPF2Q9P2E5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CHPF2Q9P2E5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CHPF2Q9P2E5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CHPF2Q9P2E5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CHPF2Q9P2E5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CHPF2Q9P2E5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CHPF2Q9P2E5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CHPF2Q9P2E5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CHPF2Q9P2E5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CHPF2Q9P2E5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CHPF2Q9P2E5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
CHPF2Q9P2E5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CHPF2Q9P2E5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CHPF2Q9P2E5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CHPF2Q9P2E5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CHPF2Q9P2E5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CHPF2Q9P2E5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CHPF2Q9P2E5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CHPF2Q9P2E5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms