Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CALCOCO1Q9P1Z2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CALCOCO1Q9P1Z2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CALCOCO1Q9P1Z2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CALCOCO1Q9P1Z2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CALCOCO1Q9P1Z2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CALCOCO1Q9P1Z2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CALCOCO1Q9P1Z2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CALCOCO1Q9P1Z2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CALCOCO1Q9P1Z2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CALCOCO1Q9P1Z2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALCOCO1Q9P1Z2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALCOCO1Q9P1Z2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALCOCO1Q9P1Z2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALCOCO1Q9P1Z2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALCOCO1Q9P1Z2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALCOCO1Q9P1Z2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALCOCO1Q9P1Z2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALCOCO1Q9P1Z2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALCOCO1Q9P1Z2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALCOCO1Q9P1Z2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALCOCO1Q9P1Z2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CALCOCO1Q9P1Z2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CALCOCO1Q9P1Z2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CALCOCO1Q9P1Z2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CALCOCO1Q9P1Z2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CALCOCO1Q9P1Z2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CALCOCO1Q9P1Z2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CALCOCO1Q9P1Z2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CALCOCO1Q9P1Z2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CALCOCO1Q9P1Z2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CALCOCO1Q9P1Z2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CALCOCO1Q9P1Z2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CALCOCO1Q9P1Z2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CALCOCO1Q9P1Z2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CALCOCO1Q9P1Z2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CALCOCO1Q9P1Z2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CALCOCO1Q9P1Z2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CALCOCO1Q9P1Z2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CALCOCO1Q9P1Z2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CALCOCO1Q9P1Z2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CALCOCO1Q9P1Z2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CALCOCO1Q9P1Z2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CALCOCO1Q9P1Z2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CALCOCO1Q9P1Z2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CALCOCO1Q9P1Z2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CALCOCO1Q9P1Z2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CALCOCO1Q9P1Z2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CALCOCO1Q9P1Z2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CALCOCO1Q9P1Z2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CALCOCO1Q9P1Z2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CALCOCO1Q9P1Z2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CALCOCO1Q9P1Z2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CALCOCO1Q9P1Z2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CALCOCO1Q9P1Z2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CALCOCO1Q9P1Z2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CALCOCO1Q9P1Z2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CALCOCO1Q9P1Z2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CALCOCO1Q9P1Z2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CALCOCO1Q9P1Z2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CALCOCO1Q9P1Z2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CALCOCO1Q9P1Z2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CALCOCO1Q9P1Z2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CALCOCO1Q9P1Z2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CALCOCO1Q9P1Z2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CALCOCO1Q9P1Z2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CALCOCO1Q9P1Z2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CALCOCO1Q9P1Z2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CALCOCO1Q9P1Z2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CALCOCO1Q9P1Z2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CALCOCO1Q9P1Z2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CALCOCO1Q9P1Z2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CALCOCO1Q9P1Z2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CALCOCO1Q9P1Z2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CALCOCO1Q9P1Z2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CALCOCO1Q9P1Z2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CALCOCO1Q9P1Z2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CALCOCO1Q9P1Z2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CALCOCO1Q9P1Z2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CALCOCO1Q9P1Z2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CALCOCO1Q9P1Z2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CALCOCO1Q9P1Z2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CALCOCO1Q9P1Z2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CALCOCO1Q9P1Z2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CALCOCO1Q9P1Z2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CALCOCO1Q9P1Z2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CALCOCO1Q9P1Z2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CALCOCO1Q9P1Z2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CALCOCO1Q9P1Z2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CALCOCO1Q9P1Z2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CALCOCO1Q9P1Z2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CALCOCO1Q9P1Z2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CALCOCO1Q9P1Z2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CALCOCO1Q9P1Z2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CALCOCO1Q9P1Z2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CALCOCO1Q9P1Z2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
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