Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U1

ACTR3B, Actin-related protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3BQ9P1U1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTR3BQ9P1U1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTR3BQ9P1U1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTR3BQ9P1U1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTR3BQ9P1U1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTR3BQ9P1U1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTR3BQ9P1U1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTR3BQ9P1U1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTR3BQ9P1U1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTR3BQ9P1U1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTR3BQ9P1U1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTR3BQ9P1U1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTR3BQ9P1U1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTR3BQ9P1U1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTR3BQ9P1U1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTR3BQ9P1U1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTR3BQ9P1U1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTR3BQ9P1U1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTR3BQ9P1U1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTR3BQ9P1U1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTR3BQ9P1U1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTR3BQ9P1U1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTR3BQ9P1U1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTR3BQ9P1U1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTR3BQ9P1U1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTR3BQ9P1U1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTR3BQ9P1U1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTR3BQ9P1U1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTR3BQ9P1U1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTR3BQ9P1U1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTR3BQ9P1U1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTR3BQ9P1U1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ACTR3BQ9P1U1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTR3BQ9P1U1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTR3BQ9P1U1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTR3BQ9P1U1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTR3BQ9P1U1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTR3BQ9P1U1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTR3BQ9P1U1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTR3BQ9P1U1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTR3BQ9P1U1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTR3BQ9P1U1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTR3BQ9P1U1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTR3BQ9P1U1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTR3BQ9P1U1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTR3BQ9P1U1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTR3BQ9P1U1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTR3BQ9P1U1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTR3BQ9P1U1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTR3BQ9P1U1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTR3BQ9P1U1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTR3BQ9P1U1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTR3BQ9P1U1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTR3BQ9P1U1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTR3BQ9P1U1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTR3BQ9P1U1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTR3BQ9P1U1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTR3BQ9P1U1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTR3BQ9P1U1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTR3BQ9P1U1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTR3BQ9P1U1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTR3BQ9P1U1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTR3BQ9P1U1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTR3BQ9P1U1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTR3BQ9P1U1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTR3BQ9P1U1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTR3BQ9P1U1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTR3BQ9P1U1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTR3BQ9P1U1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTR3BQ9P1U1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTR3BQ9P1U1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTR3BQ9P1U1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTR3BQ9P1U1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTR3BQ9P1U1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTR3BQ9P1U1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTR3BQ9P1U1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACTR3BQ9P1U1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTR3BQ9P1U1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTR3BQ9P1U1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTR3BQ9P1U1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTR3BQ9P1U1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTR3BQ9P1U1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTR3BQ9P1U1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTR3BQ9P1U1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTR3BQ9P1U1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTR3BQ9P1U1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTR3BQ9P1U1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTR3BQ9P1U1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTR3BQ9P1U1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTR3BQ9P1U1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTR3BQ9P1U1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTR3BQ9P1U1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTR3BQ9P1U1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTR3BQ9P1U1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTR3BQ9P1U1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTR3BQ9P1U1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTR3BQ9P1U1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTR3BQ9P1U1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTR3BQ9P1U1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTR3BQ9P1U1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms