Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0S2

COX16, Cytochrome c oxidase assembly protein COX16 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX16Q9P0S2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COX16Q9P0S2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COX16Q9P0S2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COX16Q9P0S2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COX16Q9P0S2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COX16Q9P0S2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COX16Q9P0S2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COX16Q9P0S2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COX16Q9P0S2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COX16Q9P0S2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COX16Q9P0S2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COX16Q9P0S2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COX16Q9P0S2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COX16Q9P0S2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COX16Q9P0S2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COX16Q9P0S2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COX16Q9P0S2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COX16Q9P0S2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COX16Q9P0S2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COX16Q9P0S2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COX16Q9P0S2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COX16Q9P0S2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
COX16Q9P0S2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COX16Q9P0S2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COX16Q9P0S2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COX16Q9P0S2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COX16Q9P0S2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COX16Q9P0S2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COX16Q9P0S2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COX16Q9P0S2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COX16Q9P0S2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COX16Q9P0S2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
COX16Q9P0S2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COX16Q9P0S2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COX16Q9P0S2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COX16Q9P0S2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COX16Q9P0S2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COX16Q9P0S2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COX16Q9P0S2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COX16Q9P0S2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COX16Q9P0S2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COX16Q9P0S2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COX16Q9P0S2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COX16Q9P0S2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COX16Q9P0S2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COX16Q9P0S2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
COX16Q9P0S2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COX16Q9P0S2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COX16Q9P0S2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COX16Q9P0S2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
COX16Q9P0S2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COX16Q9P0S2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COX16Q9P0S2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COX16Q9P0S2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COX16Q9P0S2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COX16Q9P0S2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COX16Q9P0S2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COX16Q9P0S2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COX16Q9P0S2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
COX16Q9P0S2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COX16Q9P0S2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COX16Q9P0S2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COX16Q9P0S2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COX16Q9P0S2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COX16Q9P0S2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COX16Q9P0S2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COX16Q9P0S2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COX16Q9P0S2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
COX16Q9P0S2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
COX16Q9P0S2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COX16Q9P0S2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
COX16Q9P0S2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COX16Q9P0S2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COX16Q9P0S2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COX16Q9P0S2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COX16Q9P0S2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COX16Q9P0S2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COX16Q9P0S2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COX16Q9P0S2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COX16Q9P0S2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COX16Q9P0S2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COX16Q9P0S2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COX16Q9P0S2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COX16Q9P0S2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COX16Q9P0S2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COX16Q9P0S2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COX16Q9P0S2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COX16Q9P0S2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COX16Q9P0S2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COX16Q9P0S2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COX16Q9P0S2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COX16Q9P0S2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COX16Q9P0S2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COX16Q9P0S2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COX16Q9P0S2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COX16Q9P0S2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COX16Q9P0S2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COX16Q9P0S2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COX16Q9P0S2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COX16Q9P0S2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms