Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR2

LRP1B, Low-density lipoprotein receptor-related protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 4,599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1BQ9NZR2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRP1BQ9NZR2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRP1BQ9NZR2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LRP1BQ9NZR2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRP1BQ9NZR2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRP1BQ9NZR2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LRP1BQ9NZR2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRP1BQ9NZR2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRP1BQ9NZR2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRP1BQ9NZR2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRP1BQ9NZR2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRP1BQ9NZR2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRP1BQ9NZR2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRP1BQ9NZR2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRP1BQ9NZR2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRP1BQ9NZR2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms