Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RDH8Q9NYR8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RDH8Q9NYR8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RDH8Q9NYR8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RDH8Q9NYR8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RDH8Q9NYR8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RDH8Q9NYR8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RDH8Q9NYR8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RDH8Q9NYR8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RDH8Q9NYR8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RDH8Q9NYR8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RDH8Q9NYR8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RDH8Q9NYR8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RDH8Q9NYR8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
RDH8Q9NYR8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RDH8Q9NYR8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RDH8Q9NYR8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RDH8Q9NYR8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RDH8Q9NYR8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RDH8Q9NYR8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RDH8Q9NYR8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RDH8Q9NYR8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RDH8Q9NYR8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RDH8Q9NYR8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RDH8Q9NYR8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RDH8Q9NYR8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RDH8Q9NYR8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RDH8Q9NYR8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RDH8Q9NYR8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RDH8Q9NYR8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RDH8Q9NYR8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RDH8Q9NYR8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RDH8Q9NYR8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RDH8Q9NYR8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RDH8Q9NYR8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RDH8Q9NYR8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RDH8Q9NYR8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RDH8Q9NYR8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RDH8Q9NYR8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RDH8Q9NYR8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RDH8Q9NYR8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RDH8Q9NYR8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RDH8Q9NYR8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RDH8Q9NYR8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RDH8Q9NYR8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RDH8Q9NYR8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RDH8Q9NYR8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RDH8Q9NYR8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RDH8Q9NYR8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RDH8Q9NYR8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RDH8Q9NYR8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RDH8Q9NYR8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RDH8Q9NYR8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RDH8Q9NYR8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RDH8Q9NYR8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RDH8Q9NYR8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RDH8Q9NYR8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RDH8Q9NYR8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RDH8Q9NYR8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RDH8Q9NYR8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RDH8Q9NYR8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RDH8Q9NYR8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RDH8Q9NYR8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RDH8Q9NYR8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RDH8Q9NYR8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RDH8Q9NYR8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RDH8Q9NYR8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RDH8Q9NYR8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RDH8Q9NYR8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RDH8Q9NYR8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RDH8Q9NYR8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RDH8Q9NYR8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RDH8Q9NYR8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RDH8Q9NYR8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RDH8Q9NYR8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RDH8Q9NYR8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RDH8Q9NYR8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RDH8Q9NYR8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RDH8Q9NYR8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RDH8Q9NYR8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RDH8Q9NYR8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RDH8Q9NYR8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RDH8Q9NYR8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RDH8Q9NYR8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RDH8Q9NYR8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RDH8Q9NYR8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RDH8Q9NYR8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RDH8Q9NYR8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RDH8Q9NYR8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
RDH8Q9NYR8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
RDH8Q9NYR8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RDH8Q9NYR8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RDH8Q9NYR8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RDH8Q9NYR8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RDH8Q9NYR8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RDH8Q9NYR8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RDH8Q9NYR8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RDH8Q9NYR8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RDH8Q9NYR8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RDH8Q9NYR8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms