Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
MIS18AQ9NYP9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
MIS18AQ9NYP9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
MIS18AQ9NYP9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
MIS18AQ9NYP9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
MIS18AQ9NYP9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
MIS18AQ9NYP9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
MIS18AQ9NYP9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
MIS18AQ9NYP9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
MIS18AQ9NYP9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
MIS18AQ9NYP9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
MIS18AQ9NYP9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
MIS18AQ9NYP9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
MIS18AQ9NYP9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
MIS18AQ9NYP9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
MIS18AQ9NYP9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
MIS18AQ9NYP9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
MIS18AQ9NYP9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
MIS18AQ9NYP9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
MIS18AQ9NYP9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
MIS18AQ9NYP9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
MIS18AQ9NYP9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
MIS18AQ9NYP9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
MIS18AQ9NYP9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
MIS18AQ9NYP9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
MIS18AQ9NYP9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
MIS18AQ9NYP9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
MIS18AQ9NYP9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
MIS18AQ9NYP9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
MIS18AQ9NYP9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
MIS18AQ9NYP9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
MIS18AQ9NYP9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
MIS18AQ9NYP9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
MIS18AQ9NYP9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
MIS18AQ9NYP9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
MIS18AQ9NYP9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
MIS18AQ9NYP9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
MIS18AQ9NYP9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
MIS18AQ9NYP9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
MIS18AQ9NYP9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
MIS18AQ9NYP9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
MIS18AQ9NYP9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
MIS18AQ9NYP9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
MIS18AQ9NYP9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
MIS18AQ9NYP9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
MIS18AQ9NYP9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
MIS18AQ9NYP9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
MIS18AQ9NYP9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
MIS18AQ9NYP9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
MIS18AQ9NYP9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
MIS18AQ9NYP9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
MIS18AQ9NYP9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
MIS18AQ9NYP9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
MIS18AQ9NYP9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
MIS18AQ9NYP9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
MIS18AQ9NYP9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
MIS18AQ9NYP9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
MIS18AQ9NYP9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
MIS18AQ9NYP9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
MIS18AQ9NYP9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
MIS18AQ9NYP9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
MIS18AQ9NYP9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
MIS18AQ9NYP9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
MIS18AQ9NYP9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
MIS18AQ9NYP9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC31.43■■■□□ 2.62
MIS18AQ9NYP9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
MIS18AQ9NYP9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
MIS18AQ9NYP9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
MIS18AQ9NYP9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
MIS18AQ9NYP9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
MIS18AQ9NYP9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
MIS18AQ9NYP9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
MIS18AQ9NYP9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
MIS18AQ9NYP9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
MIS18AQ9NYP9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
MIS18AQ9NYP9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
MIS18AQ9NYP9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
MIS18AQ9NYP9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
MIS18AQ9NYP9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
MIS18AQ9NYP9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
MIS18AQ9NYP9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
MIS18AQ9NYP9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.61
MIS18AQ9NYP9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
MIS18AQ9NYP9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
MIS18AQ9NYP9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
MIS18AQ9NYP9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
MIS18AQ9NYP9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
MIS18AQ9NYP9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
MIS18AQ9NYP9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
MIS18AQ9NYP9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
MIS18AQ9NYP9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
MIS18AQ9NYP9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
MIS18AQ9NYP9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
MIS18AQ9NYP9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
MIS18AQ9NYP9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
MIS18AQ9NYP9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
MIS18AQ9NYP9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
MIS18AQ9NYP9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
MIS18AQ9NYP9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
MIS18AQ9NYP9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 203.4 ms