Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DLL3Q9NYJ7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DLL3Q9NYJ7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DLL3Q9NYJ7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DLL3Q9NYJ7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DLL3Q9NYJ7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DLL3Q9NYJ7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DLL3Q9NYJ7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DLL3Q9NYJ7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DLL3Q9NYJ7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DLL3Q9NYJ7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DLL3Q9NYJ7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
DLL3Q9NYJ7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DLL3Q9NYJ7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DLL3Q9NYJ7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DLL3Q9NYJ7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DLL3Q9NYJ7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DLL3Q9NYJ7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DLL3Q9NYJ7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DLL3Q9NYJ7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DLL3Q9NYJ7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DLL3Q9NYJ7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DLL3Q9NYJ7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DLL3Q9NYJ7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DLL3Q9NYJ7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DLL3Q9NYJ7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DLL3Q9NYJ7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DLL3Q9NYJ7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
DLL3Q9NYJ7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DLL3Q9NYJ7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DLL3Q9NYJ7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms