Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA1

SPHK1, Sphingosine kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1Q9NYA1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPHK1Q9NYA1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SPHK1Q9NYA1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPHK1Q9NYA1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SPHK1Q9NYA1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPHK1Q9NYA1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPHK1Q9NYA1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPHK1Q9NYA1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPHK1Q9NYA1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPHK1Q9NYA1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPHK1Q9NYA1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPHK1Q9NYA1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPHK1Q9NYA1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPHK1Q9NYA1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPHK1Q9NYA1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPHK1Q9NYA1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPHK1Q9NYA1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SPHK1Q9NYA1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPHK1Q9NYA1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPHK1Q9NYA1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPHK1Q9NYA1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPHK1Q9NYA1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPHK1Q9NYA1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPHK1Q9NYA1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPHK1Q9NYA1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPHK1Q9NYA1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPHK1Q9NYA1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPHK1Q9NYA1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SPHK1Q9NYA1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPHK1Q9NYA1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPHK1Q9NYA1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPHK1Q9NYA1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPHK1Q9NYA1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPHK1Q9NYA1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPHK1Q9NYA1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPHK1Q9NYA1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPHK1Q9NYA1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPHK1Q9NYA1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPHK1Q9NYA1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPHK1Q9NYA1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPHK1Q9NYA1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPHK1Q9NYA1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPHK1Q9NYA1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPHK1Q9NYA1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPHK1Q9NYA1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPHK1Q9NYA1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPHK1Q9NYA1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPHK1Q9NYA1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPHK1Q9NYA1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPHK1Q9NYA1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPHK1Q9NYA1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPHK1Q9NYA1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPHK1Q9NYA1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPHK1Q9NYA1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPHK1Q9NYA1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPHK1Q9NYA1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPHK1Q9NYA1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPHK1Q9NYA1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPHK1Q9NYA1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPHK1Q9NYA1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPHK1Q9NYA1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPHK1Q9NYA1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPHK1Q9NYA1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPHK1Q9NYA1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPHK1Q9NYA1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPHK1Q9NYA1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPHK1Q9NYA1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPHK1Q9NYA1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPHK1Q9NYA1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPHK1Q9NYA1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPHK1Q9NYA1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SPHK1Q9NYA1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SPHK1Q9NYA1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPHK1Q9NYA1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPHK1Q9NYA1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPHK1Q9NYA1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPHK1Q9NYA1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPHK1Q9NYA1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPHK1Q9NYA1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPHK1Q9NYA1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPHK1Q9NYA1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPHK1Q9NYA1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPHK1Q9NYA1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPHK1Q9NYA1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPHK1Q9NYA1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPHK1Q9NYA1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPHK1Q9NYA1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPHK1Q9NYA1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPHK1Q9NYA1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPHK1Q9NYA1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPHK1Q9NYA1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPHK1Q9NYA1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPHK1Q9NYA1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPHK1Q9NYA1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPHK1Q9NYA1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPHK1Q9NYA1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPHK1Q9NYA1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPHK1Q9NYA1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPHK1Q9NYA1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPHK1Q9NYA1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms