Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY43

BARHL2, BarH-like 2 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL2Q9NY43 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BARHL2Q9NY43 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BARHL2Q9NY43 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BARHL2Q9NY43 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
BARHL2Q9NY43 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BARHL2Q9NY43 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BARHL2Q9NY43 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BARHL2Q9NY43 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BARHL2Q9NY43 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
BARHL2Q9NY43 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BARHL2Q9NY43 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BARHL2Q9NY43 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BARHL2Q9NY43 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BARHL2Q9NY43 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BARHL2Q9NY43 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BARHL2Q9NY43 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BARHL2Q9NY43 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BARHL2Q9NY43 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BARHL2Q9NY43 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BARHL2Q9NY43 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BARHL2Q9NY43 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BARHL2Q9NY43 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BARHL2Q9NY43 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BARHL2Q9NY43 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BARHL2Q9NY43 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BARHL2Q9NY43 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BARHL2Q9NY43 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BARHL2Q9NY43 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BARHL2Q9NY43 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BARHL2Q9NY43 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BARHL2Q9NY43 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BARHL2Q9NY43 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BARHL2Q9NY43 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BARHL2Q9NY43 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BARHL2Q9NY43 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BARHL2Q9NY43 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BARHL2Q9NY43 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BARHL2Q9NY43 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
BARHL2Q9NY43 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BARHL2Q9NY43 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BARHL2Q9NY43 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BARHL2Q9NY43 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BARHL2Q9NY43 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BARHL2Q9NY43 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BARHL2Q9NY43 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BARHL2Q9NY43 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BARHL2Q9NY43 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BARHL2Q9NY43 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
BARHL2Q9NY43 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BARHL2Q9NY43 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BARHL2Q9NY43 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BARHL2Q9NY43 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BARHL2Q9NY43 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BARHL2Q9NY43 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
BARHL2Q9NY43 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BARHL2Q9NY43 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BARHL2Q9NY43 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BARHL2Q9NY43 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BARHL2Q9NY43 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
BARHL2Q9NY43 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BARHL2Q9NY43 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BARHL2Q9NY43 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BARHL2Q9NY43 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BARHL2Q9NY43 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BARHL2Q9NY43 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
BARHL2Q9NY43 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BARHL2Q9NY43 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BARHL2Q9NY43 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BARHL2Q9NY43 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BARHL2Q9NY43 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BARHL2Q9NY43 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
BARHL2Q9NY43 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BARHL2Q9NY43 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BARHL2Q9NY43 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BARHL2Q9NY43 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BARHL2Q9NY43 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
BARHL2Q9NY43 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BARHL2Q9NY43 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BARHL2Q9NY43 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BARHL2Q9NY43 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BARHL2Q9NY43 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BARHL2Q9NY43 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BARHL2Q9NY43 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BARHL2Q9NY43 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BARHL2Q9NY43 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BARHL2Q9NY43 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BARHL2Q9NY43 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BARHL2Q9NY43 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BARHL2Q9NY43 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BARHL2Q9NY43 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BARHL2Q9NY43 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BARHL2Q9NY43 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
BARHL2Q9NY43 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BARHL2Q9NY43 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BARHL2Q9NY43 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BARHL2Q9NY43 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BARHL2Q9NY43 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
BARHL2Q9NY43 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BARHL2Q9NY43 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BARHL2Q9NY43 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms