Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 PPP1R16A-208ENST00000529283 636 ntTSL 524.92■■□□□ 1.581e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.521e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 KIFC3-223ENST00000565684 623 ntTSL 524.08■■□□□ 1.451e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 SPIN3-244ENST00000640728 1954 ntTSL 523.03■■□□□ 1.281e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.251e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 IFNGR2-205ENST00000439213 906 ntTSL 522.66■■□□□ 1.221e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 NIN-207ENST00000453401 1418 ntTSL 1 (best)22.56■■□□□ 1.21e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 TPRA1-206ENST00000465915 569 ntTSL 321.61■■□□□ 1.051e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 PPP1R16A-210ENST00000533088 577 ntTSL 221.17■□□□□ 0.981e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 RPS28-202ENST00000449223 1523 ntTSL 220.67■□□□□ 0.91e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.871e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 PBX3-211ENST00000497091 425 ntTSL 520.41■□□□□ 0.861e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 HDAC10-204ENST00000429374 1634 ntTSL 1 (best)20.34■□□□□ 0.852e-6■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 FMR1-209ENST00000463120 470 ntTSL 220.28■□□□□ 0.843e-36■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 HDAC10-221ENST00000498366 2153 ntTSL 520.12■□□□□ 0.812e-6■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.81e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.781e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 HDAC10-214ENST00000483222 2091 ntTSL 519.77■□□□□ 0.762e-6■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 PBX3-202ENST00000373482 1130 ntTSL 1 (best)19.61■□□□□ 0.731e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 PBX3-205ENST00000373492 950 ntTSL 1 (best)19.61■□□□□ 0.731e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.731e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.722e-6■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 IFNGR2-206ENST00000545369 966 ntTSL 519.56■□□□□ 0.721e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.682e-6■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 SPIN3-238ENST00000640421 1872 ntTSL 519.18■□□□□ 0.661e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.651e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.651e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.641e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.631e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 SPIN3-220ENST00000639257 1009 ntTSL 318.98■□□□□ 0.631e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.611e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 SPIN3-203ENST00000478405 1620 ntTSL 1 (best)18.85■□□□□ 0.611e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.64e-14■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 HDAC10-203ENST00000415993 2375 ntTSL 1 (best)18.68■□□□□ 0.582e-6■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.572e-6■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.521e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.511e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 SLC25A30-203ENST00000519547 582 ntTSL 418.2■□□□□ 0.51e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 PBX3-209ENST00000491787 875 ntTSL 518.19■□□□□ 0.51e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.51e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 SPIN3-228ENST00000639794 1681 ntTSL 518.15■□□□□ 0.51e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.421e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 KIFC3-228ENST00000566975 580 ntTSL 417.58■□□□□ 0.41e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 KIFC3-208ENST00000561524 577 ntTSL 417.58■□□□□ 0.41e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.41e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.391e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 SPIN3-217ENST00000639000 2055 ntTSL 517.42■□□□□ 0.381e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.381e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 TECPR2-204ENST00000559124 491 ntTSL 217.33■□□□□ 0.361e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.351e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.331e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 KIFC3-210ENST00000562503 737 ntTSL 417.07■□□□□ 0.321e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 TKT-212ENST00000483706 565 ntTSL 216.97■□□□□ 0.311e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 SPIN3-233ENST00000640039 1067 ntTSL 516.93■□□□□ 0.31e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.291e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.281e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 LZTR1-216ENST00000495142 720 ntTSL 316.79■□□□□ 0.289e-54■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 SPIN3-240ENST00000640507 1436 ntTSL 516.79■□□□□ 0.281e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.281e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 PPP1R16A-211ENST00000533829 558 ntTSL 316.74■□□□□ 0.271e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.271e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 SPIN3-242ENST00000640577 2436 ntTSL 516.72■□□□□ 0.271e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 SPIN3-229ENST00000639809 1118 ntTSL 516.71■□□□□ 0.271e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.241e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.241e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.231e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.221e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 TBC1D17-204ENST00000594996 1161 ntTSL 1 (best)16.44■□□□□ 0.221e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.221e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 SPIN3-219ENST00000639053 1778 ntTSL 516.39■□□□□ 0.211e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 SLC25A30-202ENST00000463262 426 ntTSL 316.34■□□□□ 0.211e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 TKT-211ENST00000472528 1055 ntTSL 1 (best)16.34■□□□□ 0.211e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 KIFC3-226ENST00000566648 651 ntTSL 316.33■□□□□ 0.21e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.181e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 SPIN3-202ENST00000475785 1717 ntTSL 516.11■□□□□ 0.171e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 SPIN3-208ENST00000638481 2050 ntTSL 516.05■□□□□ 0.161e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 KIFC3-232ENST00000569112 564 ntTSL 415.97■□□□□ 0.151e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.134e-24■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.123e-6■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.111e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.111e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.11e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 SPIN3-213ENST00000638834 856 ntTSL 515.68■□□□□ 0.11e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.091e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 SPIN3-214ENST00000638845 2010 ntTSL 515.54■□□□□ 0.081e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 LZTR1-213ENST00000491432 527 ntTSL 315.53■□□□□ 0.089e-54■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 SEMA5B-209ENST00000475244 4733 ntTSL 515.52■□□□□ 0.081e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.071e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.071e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.061e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 KIFC3-230ENST00000567204 516 ntTSL 415.38■□□□□ 0.051e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.051e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 SPIN3-239ENST00000640463 3133 ntTSL 515.17■□□□□ 0.021e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.013e-36■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -06e-13■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 TRIM2-206ENST00000479711 909 ntTSL 214.98□□□□□ -0.011e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 TRIM2-210ENST00000496978 542 ntTSL 414.98□□□□□ -0.011e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.021e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 SPIN3-210ENST00000638664 2793 ntTSL 514.9□□□□□ -0.021e-18■■■■■ 447.2
UTP3Q9NQZ2 TBC1D17-206ENST00000598789 556 ntTSL 414.9□□□□□ -0.021e-18■■■■■ 447.2
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 3775.4 ms