RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640728.1

SPIN3-244, Transcript of spindlin family member 3, humanhuman

TSL 5

Gene SPIN3, Length 1,954 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3-244ENST00000640728 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.13■■■■■ 5.3
SPIN3-244ENST00000640728 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.82■■■■■ 4.29
SPIN3-244ENST00000640728 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.44■■■■■ 4.06
SPIN3-244ENST00000640728 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.79■■■■□ 3.96
SPIN3-244ENST00000640728 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.78■■■■□ 3.96
SPIN3-244ENST00000640728 ABCC9O60706 1549 aa39.58■■■■□ 3.93
SPIN3-244ENST00000640728 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.35■■■■□ 3.89
SPIN3-244ENST00000640728 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.29■■■■□ 3.88
SPIN3-244ENST00000640728 NACADO15069 1562 aa39■■■■□ 3.83
SPIN3-244ENST00000640728 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.63■■■■□ 3.77
SPIN3-244ENST00000640728 SCRIBQ14160 1630 aa38.52■■■■□ 3.76
SPIN3-244ENST00000640728 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.93■■■■□ 3.66
SPIN3-244ENST00000640728 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.76■■■■□ 3.64
SPIN3-244ENST00000640728 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.49■■■■□ 3.59
SPIN3-244ENST00000640728 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.43■■■■□ 3.58
SPIN3-244ENST00000640728 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.41■■■■□ 3.58
SPIN3-244ENST00000640728 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.41■■■■□ 3.58
SPIN3-244ENST00000640728 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.19■■■■□ 3.54
SPIN3-244ENST00000640728 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.13■■■■□ 3.53
SPIN3-244ENST00000640728 SMARCA4P51532 1647 aa36.93■■■■□ 3.5
SPIN3-244ENST00000640728 WIZO95785 1651 aa36.84■■■■□ 3.49
SPIN3-244ENST00000640728 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.5■■■■□ 3.43
SPIN3-244ENST00000640728 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.48■■■■□ 3.43
SPIN3-244ENST00000640728 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.38■■■■□ 3.42
SPIN3-244ENST00000640728 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.37■■■■□ 3.41
SPIN3-244ENST00000640728 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.34■■■■□ 3.41
SPIN3-244ENST00000640728 SMARCA2P51531 1590 aa36.3■■■■□ 3.4
SPIN3-244ENST00000640728 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.17■■■■□ 3.38
SPIN3-244ENST00000640728 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.14■■■■□ 3.38
SPIN3-244ENST00000640728 NCAPD3P42695 1498 aa36.06■■■■□ 3.36
SPIN3-244ENST00000640728 HMGXB3Q12766 1538 aa35.95■■■■□ 3.34
SPIN3-244ENST00000640728 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.78■■■■□ 3.32
SPIN3-244ENST00000640728 TRIM41Q8WV44 630 aa35.66■■■■□ 3.3
SPIN3-244ENST00000640728 ABCC8Q09428 1581 aa35.38■■■■□ 3.25
SPIN3-244ENST00000640728 CFTRP13569 1480 aa35.27■■■■□ 3.24
SPIN3-244ENST00000640728 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.19■■■■□ 3.22
SPIN3-244ENST00000640728 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.16■■■■□ 3.22
SPIN3-244ENST00000640728 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35■■■■□ 3.19
SPIN3-244ENST00000640728 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35■■■■□ 3.19
SPIN3-244ENST00000640728 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35■■■■□ 3.19
SPIN3-244ENST00000640728 SYNJ1O43426 1573 aa34.99■■■■□ 3.19
SPIN3-244ENST00000640728 PRDM2Q13029 1718 aa34.9■■■■□ 3.18
SPIN3-244ENST00000640728 TOP2BQ02880 1626 aa34.84■■■■□ 3.17
SPIN3-244ENST00000640728 SOGA1O94964 1423 aa34.8■■■■□ 3.16
SPIN3-244ENST00000640728 NESP48681 1621 aa34.78■■■■□ 3.16
SPIN3-244ENST00000640728 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.77■■■■□ 3.16
SPIN3-244ENST00000640728 CUX1P39880 1505 aa34.76■■■■□ 3.15
SPIN3-244ENST00000640728 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.74■■■■□ 3.15
SPIN3-244ENST00000640728 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.73■■■■□ 3.15
SPIN3-244ENST00000640728 EEA1Q15075 1411 aa34.72■■■■□ 3.15
SPIN3-244ENST00000640728 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.66■■■■□ 3.14
SPIN3-244ENST00000640728 CSRNP3Q8WYN3 585 aa34.59■■■■□ 3.13
SPIN3-244ENST00000640728 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.53■■■■□ 3.12
SPIN3-244ENST00000640728 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.49■■■■□ 3.11
SPIN3-244ENST00000640728 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.47■■■■□ 3.11
SPIN3-244ENST00000640728 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.39■■■■□ 3.1
SPIN3-244ENST00000640728 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.36■■■■□ 3.09
SPIN3-244ENST00000640728 TOPBP1Q92547 1522 aa34.35■■■■□ 3.09
SPIN3-244ENST00000640728 KIF27Q86VH2 1401 aa34.29■■■■□ 3.08
SPIN3-244ENST00000640728 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.29■■■■□ 3.08
SPIN3-244ENST00000640728 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.25■■■■□ 3.07
SPIN3-244ENST00000640728 GOLGA3Q08378 1498 aa34.23■■■■□ 3.07
SPIN3-244ENST00000640728 KIF21BO75037 1637 aa34.21■■■■□ 3.07
SPIN3-244ENST00000640728 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.2■■■■□ 3.07
SPIN3-244ENST00000640728 TNIKQ9UKE5 1360 aa34.19■■■■□ 3.06
SPIN3-244ENST00000640728 CUX2O14529 1486 aa34.17■■■■□ 3.06
SPIN3-244ENST00000640728 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.12■■■■□ 3.05
SPIN3-244ENST00000640728 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.11■■■■□ 3.05
SPIN3-244ENST00000640728 PRXQ9BXM0 1461 aa34.1■■■■□ 3.05
SPIN3-244ENST00000640728 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.08■■■■□ 3.05
SPIN3-244ENST00000640728 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.07■■■■□ 3.04
SPIN3-244ENST00000640728 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.06■■■■□ 3.04
SPIN3-244ENST00000640728 IGF1RP08069 1367 aa34.04■■■■□ 3.04
SPIN3-244ENST00000640728 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.99■■■■□ 3.03
SPIN3-244ENST00000640728 CEP162Q5TB80 1403 aa33.98■■■■□ 3.03
SPIN3-244ENST00000640728 ERCC6Q03468 1493 aa33.9■■■■□ 3.02
SPIN3-244ENST00000640728 WDR62O43379 1518 aa33.86■■■■□ 3.01
SPIN3-244ENST00000640728 WDR97A6NE52 1622 aa33.86■■■■□ 3.01
SPIN3-244ENST00000640728 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.84■■■■□ 3.01
SPIN3-244ENST00000640728 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.8■■■■□ 3
SPIN3-244ENST00000640728 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.8■■■■□ 3
SPIN3-244ENST00000640728 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.73■■■□□ 2.99
SPIN3-244ENST00000640728 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.72■■■□□ 2.99
SPIN3-244ENST00000640728 CLIP1P30622 1438 aa33.71■■■□□ 2.99
SPIN3-244ENST00000640728 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.7■■■□□ 2.99
SPIN3-244ENST00000640728 IFT140Q96RY7 1462 aa33.67■■■□□ 2.98
SPIN3-244ENST00000640728 CUL7Q14999 1698 aa33.62■■■□□ 2.97
SPIN3-244ENST00000640728 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.55■■■□□ 2.96
SPIN3-244ENST00000640728 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP33.54■■■□□ 2.96
SPIN3-244ENST00000640728 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.5■■■□□ 2.95
SPIN3-244ENST00000640728 PCGF6Q9BYE7 350 aa33.45■■■□□ 2.95
SPIN3-244ENST00000640728 GRIN2BQ13224 1484 aa33.44■■■□□ 2.94
SPIN3-244ENST00000640728 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP33.44■■■□□ 2.94
SPIN3-244ENST00000640728 VPS8Q8N3P4 1428 aa33.42■■■□□ 2.94
SPIN3-244ENST00000640728 PBRM1Q86U86 1689 aa33.4■■■□□ 2.94
SPIN3-244ENST00000640728 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.37■■■□□ 2.93
SPIN3-244ENST00000640728 ARAP1Q96P48 1450 aa33.36■■■□□ 2.93
SPIN3-244ENST00000640728 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa33.35■■■□□ 2.93
SPIN3-244ENST00000640728 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP33.32■■■□□ 2.93
SPIN3-244ENST00000640728 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.3■■■□□ 2.92
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