Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB6

PARD6A, Partitioning defective 6 homolog alpha, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6AQ9NPB6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PARD6AQ9NPB6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PARD6AQ9NPB6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PARD6AQ9NPB6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PARD6AQ9NPB6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PARD6AQ9NPB6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PARD6AQ9NPB6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PARD6AQ9NPB6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PARD6AQ9NPB6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PARD6AQ9NPB6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PARD6AQ9NPB6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PARD6AQ9NPB6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PARD6AQ9NPB6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PARD6AQ9NPB6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PARD6AQ9NPB6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PARD6AQ9NPB6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PARD6AQ9NPB6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PARD6AQ9NPB6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PARD6AQ9NPB6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PARD6AQ9NPB6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PARD6AQ9NPB6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PARD6AQ9NPB6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PARD6AQ9NPB6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARD6AQ9NPB6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARD6AQ9NPB6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARD6AQ9NPB6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARD6AQ9NPB6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARD6AQ9NPB6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARD6AQ9NPB6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARD6AQ9NPB6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARD6AQ9NPB6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARD6AQ9NPB6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARD6AQ9NPB6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARD6AQ9NPB6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PARD6AQ9NPB6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PARD6AQ9NPB6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PARD6AQ9NPB6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PARD6AQ9NPB6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PARD6AQ9NPB6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PARD6AQ9NPB6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PARD6AQ9NPB6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PARD6AQ9NPB6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PARD6AQ9NPB6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PARD6AQ9NPB6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PARD6AQ9NPB6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PARD6AQ9NPB6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PARD6AQ9NPB6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PARD6AQ9NPB6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PARD6AQ9NPB6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PARD6AQ9NPB6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PARD6AQ9NPB6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PARD6AQ9NPB6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PARD6AQ9NPB6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PARD6AQ9NPB6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PARD6AQ9NPB6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PARD6AQ9NPB6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PARD6AQ9NPB6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PARD6AQ9NPB6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PARD6AQ9NPB6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PARD6AQ9NPB6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PARD6AQ9NPB6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PARD6AQ9NPB6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PARD6AQ9NPB6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PARD6AQ9NPB6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PARD6AQ9NPB6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PARD6AQ9NPB6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PARD6AQ9NPB6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PARD6AQ9NPB6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PARD6AQ9NPB6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PARD6AQ9NPB6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PARD6AQ9NPB6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PARD6AQ9NPB6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PARD6AQ9NPB6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PARD6AQ9NPB6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PARD6AQ9NPB6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PARD6AQ9NPB6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PARD6AQ9NPB6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PARD6AQ9NPB6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PARD6AQ9NPB6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PARD6AQ9NPB6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PARD6AQ9NPB6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PARD6AQ9NPB6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PARD6AQ9NPB6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PARD6AQ9NPB6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PARD6AQ9NPB6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PARD6AQ9NPB6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PARD6AQ9NPB6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PARD6AQ9NPB6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PARD6AQ9NPB6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PARD6AQ9NPB6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PARD6AQ9NPB6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PARD6AQ9NPB6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PARD6AQ9NPB6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PARD6AQ9NPB6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PARD6AQ9NPB6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PARD6AQ9NPB6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PARD6AQ9NPB6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PARD6AQ9NPB6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PARD6AQ9NPB6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PARD6AQ9NPB6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms