Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSU72Q9NP77 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSU72Q9NP77 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSU72Q9NP77 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSU72Q9NP77 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSU72Q9NP77 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSU72Q9NP77 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSU72Q9NP77 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSU72Q9NP77 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSU72Q9NP77 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SSU72Q9NP77 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSU72Q9NP77 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSU72Q9NP77 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSU72Q9NP77 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSU72Q9NP77 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SSU72Q9NP77 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSU72Q9NP77 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSU72Q9NP77 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSU72Q9NP77 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSU72Q9NP77 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSU72Q9NP77 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSU72Q9NP77 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSU72Q9NP77 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSU72Q9NP77 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSU72Q9NP77 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSU72Q9NP77 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSU72Q9NP77 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSU72Q9NP77 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSU72Q9NP77 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSU72Q9NP77 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSU72Q9NP77 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSU72Q9NP77 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSU72Q9NP77 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSU72Q9NP77 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSU72Q9NP77 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSU72Q9NP77 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSU72Q9NP77 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSU72Q9NP77 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SSU72Q9NP77 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSU72Q9NP77 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSU72Q9NP77 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSU72Q9NP77 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSU72Q9NP77 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSU72Q9NP77 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SSU72Q9NP77 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SSU72Q9NP77 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSU72Q9NP77 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSU72Q9NP77 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSU72Q9NP77 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSU72Q9NP77 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SSU72Q9NP77 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSU72Q9NP77 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSU72Q9NP77 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSU72Q9NP77 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSU72Q9NP77 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSU72Q9NP77 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSU72Q9NP77 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSU72Q9NP77 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SSU72Q9NP77 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SSU72Q9NP77 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SSU72Q9NP77 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSU72Q9NP77 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSU72Q9NP77 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSU72Q9NP77 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSU72Q9NP77 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSU72Q9NP77 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSU72Q9NP77 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSU72Q9NP77 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSU72Q9NP77 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSU72Q9NP77 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSU72Q9NP77 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSU72Q9NP77 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSU72Q9NP77 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSU72Q9NP77 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSU72Q9NP77 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSU72Q9NP77 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSU72Q9NP77 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSU72Q9NP77 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSU72Q9NP77 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSU72Q9NP77 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSU72Q9NP77 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSU72Q9NP77 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSU72Q9NP77 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSU72Q9NP77 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSU72Q9NP77 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSU72Q9NP77 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSU72Q9NP77 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSU72Q9NP77 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSU72Q9NP77 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSU72Q9NP77 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SSU72Q9NP77 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSU72Q9NP77 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSU72Q9NP77 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSU72Q9NP77 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSU72Q9NP77 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSU72Q9NP77 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SSU72Q9NP77 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SSU72Q9NP77 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SSU72Q9NP77 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SSU72Q9NP77 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms