Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZCCHC17Q9NP64 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZCCHC17Q9NP64 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
ZCCHC17Q9NP64 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZCCHC17Q9NP64 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZCCHC17Q9NP64 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ZCCHC17Q9NP64 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZCCHC17Q9NP64 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZCCHC17Q9NP64 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZCCHC17Q9NP64 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZCCHC17Q9NP64 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZCCHC17Q9NP64 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZCCHC17Q9NP64 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZCCHC17Q9NP64 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZCCHC17Q9NP64 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZCCHC17Q9NP64 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZCCHC17Q9NP64 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZCCHC17Q9NP64 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZCCHC17Q9NP64 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZCCHC17Q9NP64 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZCCHC17Q9NP64 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZCCHC17Q9NP64 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ZCCHC17Q9NP64 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZCCHC17Q9NP64 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZCCHC17Q9NP64 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZCCHC17Q9NP64 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ZCCHC17Q9NP64 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZCCHC17Q9NP64 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZCCHC17Q9NP64 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZCCHC17Q9NP64 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZCCHC17Q9NP64 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZCCHC17Q9NP64 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZCCHC17Q9NP64 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ZCCHC17Q9NP64 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZCCHC17Q9NP64 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZCCHC17Q9NP64 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZCCHC17Q9NP64 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZCCHC17Q9NP64 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZCCHC17Q9NP64 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZCCHC17Q9NP64 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZCCHC17Q9NP64 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZCCHC17Q9NP64 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ZCCHC17Q9NP64 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ZCCHC17Q9NP64 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZCCHC17Q9NP64 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZCCHC17Q9NP64 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZCCHC17Q9NP64 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ZCCHC17Q9NP64 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZCCHC17Q9NP64 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZCCHC17Q9NP64 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZCCHC17Q9NP64 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZCCHC17Q9NP64 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ZCCHC17Q9NP64 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZCCHC17Q9NP64 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZCCHC17Q9NP64 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZCCHC17Q9NP64 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZCCHC17Q9NP64 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ZCCHC17Q9NP64 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZCCHC17Q9NP64 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZCCHC17Q9NP64 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZCCHC17Q9NP64 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZCCHC17Q9NP64 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZCCHC17Q9NP64 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZCCHC17Q9NP64 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZCCHC17Q9NP64 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZCCHC17Q9NP64 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZCCHC17Q9NP64 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZCCHC17Q9NP64 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZCCHC17Q9NP64 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZCCHC17Q9NP64 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZCCHC17Q9NP64 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZCCHC17Q9NP64 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZCCHC17Q9NP64 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZCCHC17Q9NP64 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZCCHC17Q9NP64 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZCCHC17Q9NP64 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZCCHC17Q9NP64 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZCCHC17Q9NP64 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZCCHC17Q9NP64 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZCCHC17Q9NP64 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZCCHC17Q9NP64 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZCCHC17Q9NP64 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZCCHC17Q9NP64 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZCCHC17Q9NP64 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZCCHC17Q9NP64 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZCCHC17Q9NP64 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZCCHC17Q9NP64 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZCCHC17Q9NP64 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZCCHC17Q9NP64 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZCCHC17Q9NP64 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZCCHC17Q9NP64 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZCCHC17Q9NP64 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ZCCHC17Q9NP64 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZCCHC17Q9NP64 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZCCHC17Q9NP64 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZCCHC17Q9NP64 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ZCCHC17Q9NP64 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZCCHC17Q9NP64 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZCCHC17Q9NP64 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZCCHC17Q9NP64 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms