Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9C1

VIPAS39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPAS39Q9H9C1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VIPAS39Q9H9C1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VIPAS39Q9H9C1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VIPAS39Q9H9C1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VIPAS39Q9H9C1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VIPAS39Q9H9C1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VIPAS39Q9H9C1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VIPAS39Q9H9C1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VIPAS39Q9H9C1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VIPAS39Q9H9C1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VIPAS39Q9H9C1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VIPAS39Q9H9C1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
VIPAS39Q9H9C1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VIPAS39Q9H9C1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VIPAS39Q9H9C1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VIPAS39Q9H9C1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VIPAS39Q9H9C1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VIPAS39Q9H9C1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VIPAS39Q9H9C1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VIPAS39Q9H9C1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VIPAS39Q9H9C1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VIPAS39Q9H9C1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VIPAS39Q9H9C1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VIPAS39Q9H9C1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VIPAS39Q9H9C1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VIPAS39Q9H9C1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VIPAS39Q9H9C1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VIPAS39Q9H9C1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VIPAS39Q9H9C1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VIPAS39Q9H9C1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VIPAS39Q9H9C1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VIPAS39Q9H9C1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VIPAS39Q9H9C1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VIPAS39Q9H9C1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VIPAS39Q9H9C1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VIPAS39Q9H9C1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VIPAS39Q9H9C1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VIPAS39Q9H9C1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VIPAS39Q9H9C1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VIPAS39Q9H9C1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VIPAS39Q9H9C1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VIPAS39Q9H9C1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
VIPAS39Q9H9C1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VIPAS39Q9H9C1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VIPAS39Q9H9C1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VIPAS39Q9H9C1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VIPAS39Q9H9C1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VIPAS39Q9H9C1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VIPAS39Q9H9C1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VIPAS39Q9H9C1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VIPAS39Q9H9C1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VIPAS39Q9H9C1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VIPAS39Q9H9C1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VIPAS39Q9H9C1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VIPAS39Q9H9C1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VIPAS39Q9H9C1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VIPAS39Q9H9C1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VIPAS39Q9H9C1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VIPAS39Q9H9C1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VIPAS39Q9H9C1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VIPAS39Q9H9C1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VIPAS39Q9H9C1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VIPAS39Q9H9C1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VIPAS39Q9H9C1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VIPAS39Q9H9C1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VIPAS39Q9H9C1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VIPAS39Q9H9C1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VIPAS39Q9H9C1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VIPAS39Q9H9C1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VIPAS39Q9H9C1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VIPAS39Q9H9C1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VIPAS39Q9H9C1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VIPAS39Q9H9C1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VIPAS39Q9H9C1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VIPAS39Q9H9C1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VIPAS39Q9H9C1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VIPAS39Q9H9C1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VIPAS39Q9H9C1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VIPAS39Q9H9C1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VIPAS39Q9H9C1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
VIPAS39Q9H9C1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VIPAS39Q9H9C1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VIPAS39Q9H9C1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VIPAS39Q9H9C1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VIPAS39Q9H9C1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VIPAS39Q9H9C1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VIPAS39Q9H9C1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VIPAS39Q9H9C1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VIPAS39Q9H9C1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VIPAS39Q9H9C1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VIPAS39Q9H9C1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VIPAS39Q9H9C1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VIPAS39Q9H9C1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VIPAS39Q9H9C1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VIPAS39Q9H9C1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VIPAS39Q9H9C1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VIPAS39Q9H9C1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VIPAS39Q9H9C1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VIPAS39Q9H9C1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VIPAS39Q9H9C1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms