Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TAF1DQ9H5J8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TAF1DQ9H5J8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TAF1DQ9H5J8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
TAF1DQ9H5J8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TAF1DQ9H5J8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TAF1DQ9H5J8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TAF1DQ9H5J8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TAF1DQ9H5J8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TAF1DQ9H5J8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
TAF1DQ9H5J8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TAF1DQ9H5J8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
TAF1DQ9H5J8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TAF1DQ9H5J8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TAF1DQ9H5J8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TAF1DQ9H5J8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TAF1DQ9H5J8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
TAF1DQ9H5J8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TAF1DQ9H5J8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TAF1DQ9H5J8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TAF1DQ9H5J8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TAF1DQ9H5J8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TAF1DQ9H5J8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TAF1DQ9H5J8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
TAF1DQ9H5J8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TAF1DQ9H5J8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TAF1DQ9H5J8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TAF1DQ9H5J8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TAF1DQ9H5J8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TAF1DQ9H5J8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TAF1DQ9H5J8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TAF1DQ9H5J8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TAF1DQ9H5J8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TAF1DQ9H5J8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TAF1DQ9H5J8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TAF1DQ9H5J8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TAF1DQ9H5J8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TAF1DQ9H5J8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TAF1DQ9H5J8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TAF1DQ9H5J8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TAF1DQ9H5J8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TAF1DQ9H5J8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TAF1DQ9H5J8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TAF1DQ9H5J8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TAF1DQ9H5J8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TAF1DQ9H5J8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TAF1DQ9H5J8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TAF1DQ9H5J8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TAF1DQ9H5J8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TAF1DQ9H5J8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TAF1DQ9H5J8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TAF1DQ9H5J8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TAF1DQ9H5J8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TAF1DQ9H5J8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
TAF1DQ9H5J8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TAF1DQ9H5J8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
TAF1DQ9H5J8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TAF1DQ9H5J8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
TAF1DQ9H5J8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TAF1DQ9H5J8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TAF1DQ9H5J8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TAF1DQ9H5J8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TAF1DQ9H5J8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TAF1DQ9H5J8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TAF1DQ9H5J8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TAF1DQ9H5J8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
TAF1DQ9H5J8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TAF1DQ9H5J8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TAF1DQ9H5J8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TAF1DQ9H5J8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TAF1DQ9H5J8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TAF1DQ9H5J8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TAF1DQ9H5J8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TAF1DQ9H5J8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
TAF1DQ9H5J8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TAF1DQ9H5J8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TAF1DQ9H5J8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TAF1DQ9H5J8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TAF1DQ9H5J8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TAF1DQ9H5J8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TAF1DQ9H5J8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TAF1DQ9H5J8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TAF1DQ9H5J8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TAF1DQ9H5J8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
TAF1DQ9H5J8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
TAF1DQ9H5J8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TAF1DQ9H5J8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TAF1DQ9H5J8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TAF1DQ9H5J8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TAF1DQ9H5J8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TAF1DQ9H5J8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TAF1DQ9H5J8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TAF1DQ9H5J8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
TAF1DQ9H5J8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TAF1DQ9H5J8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
TAF1DQ9H5J8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TAF1DQ9H5J8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TAF1DQ9H5J8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TAF1DQ9H5J8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TAF1DQ9H5J8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms