Protein–RNA interactions for Protein: Q9H270

VPS11, Vacuolar protein sorting-associated protein 11 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS11Q9H270 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS11Q9H270 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS11Q9H270 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS11Q9H270 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS11Q9H270 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS11Q9H270 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS11Q9H270 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS11Q9H270 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS11Q9H270 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS11Q9H270 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS11Q9H270 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS11Q9H270 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS11Q9H270 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS11Q9H270 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS11Q9H270 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS11Q9H270 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS11Q9H270 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS11Q9H270 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS11Q9H270 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS11Q9H270 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS11Q9H270 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS11Q9H270 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS11Q9H270 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS11Q9H270 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS11Q9H270 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS11Q9H270 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VPS11Q9H270 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS11Q9H270 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS11Q9H270 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS11Q9H270 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS11Q9H270 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS11Q9H270 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS11Q9H270 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS11Q9H270 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS11Q9H270 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS11Q9H270 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VPS11Q9H270 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VPS11Q9H270 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VPS11Q9H270 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS11Q9H270 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS11Q9H270 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS11Q9H270 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS11Q9H270 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS11Q9H270 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS11Q9H270 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS11Q9H270 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS11Q9H270 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS11Q9H270 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS11Q9H270 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS11Q9H270 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS11Q9H270 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS11Q9H270 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS11Q9H270 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS11Q9H270 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS11Q9H270 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS11Q9H270 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS11Q9H270 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS11Q9H270 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS11Q9H270 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS11Q9H270 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS11Q9H270 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS11Q9H270 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS11Q9H270 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS11Q9H270 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS11Q9H270 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS11Q9H270 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS11Q9H270 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS11Q9H270 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS11Q9H270 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS11Q9H270 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS11Q9H270 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS11Q9H270 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS11Q9H270 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS11Q9H270 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS11Q9H270 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS11Q9H270 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS11Q9H270 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS11Q9H270 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS11Q9H270 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS11Q9H270 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS11Q9H270 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS11Q9H270 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS11Q9H270 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS11Q9H270 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS11Q9H270 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
VPS11Q9H270 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
VPS11Q9H270 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VPS11Q9H270 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VPS11Q9H270 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VPS11Q9H270 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VPS11Q9H270 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS11Q9H270 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS11Q9H270 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS11Q9H270 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS11Q9H270 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS11Q9H270 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS11Q9H270 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS11Q9H270 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS11Q9H270 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS11Q9H270 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.8 ms