Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZQ3

COMMD5, COMM domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD5Q9GZQ3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
COMMD5Q9GZQ3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
COMMD5Q9GZQ3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
COMMD5Q9GZQ3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
COMMD5Q9GZQ3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
COMMD5Q9GZQ3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
COMMD5Q9GZQ3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
COMMD5Q9GZQ3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
COMMD5Q9GZQ3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
COMMD5Q9GZQ3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
COMMD5Q9GZQ3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
COMMD5Q9GZQ3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
COMMD5Q9GZQ3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
COMMD5Q9GZQ3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
COMMD5Q9GZQ3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
COMMD5Q9GZQ3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
COMMD5Q9GZQ3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
COMMD5Q9GZQ3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
COMMD5Q9GZQ3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
COMMD5Q9GZQ3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
COMMD5Q9GZQ3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
COMMD5Q9GZQ3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
COMMD5Q9GZQ3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
COMMD5Q9GZQ3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
COMMD5Q9GZQ3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
COMMD5Q9GZQ3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COMMD5Q9GZQ3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COMMD5Q9GZQ3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COMMD5Q9GZQ3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COMMD5Q9GZQ3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COMMD5Q9GZQ3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COMMD5Q9GZQ3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COMMD5Q9GZQ3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COMMD5Q9GZQ3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COMMD5Q9GZQ3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COMMD5Q9GZQ3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COMMD5Q9GZQ3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COMMD5Q9GZQ3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COMMD5Q9GZQ3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COMMD5Q9GZQ3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COMMD5Q9GZQ3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COMMD5Q9GZQ3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COMMD5Q9GZQ3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COMMD5Q9GZQ3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COMMD5Q9GZQ3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COMMD5Q9GZQ3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COMMD5Q9GZQ3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COMMD5Q9GZQ3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COMMD5Q9GZQ3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COMMD5Q9GZQ3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COMMD5Q9GZQ3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COMMD5Q9GZQ3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COMMD5Q9GZQ3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COMMD5Q9GZQ3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COMMD5Q9GZQ3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COMMD5Q9GZQ3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
COMMD5Q9GZQ3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COMMD5Q9GZQ3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COMMD5Q9GZQ3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
COMMD5Q9GZQ3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
COMMD5Q9GZQ3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
COMMD5Q9GZQ3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
COMMD5Q9GZQ3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
COMMD5Q9GZQ3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
COMMD5Q9GZQ3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COMMD5Q9GZQ3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COMMD5Q9GZQ3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COMMD5Q9GZQ3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COMMD5Q9GZQ3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COMMD5Q9GZQ3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COMMD5Q9GZQ3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COMMD5Q9GZQ3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COMMD5Q9GZQ3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COMMD5Q9GZQ3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COMMD5Q9GZQ3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COMMD5Q9GZQ3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COMMD5Q9GZQ3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COMMD5Q9GZQ3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COMMD5Q9GZQ3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COMMD5Q9GZQ3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COMMD5Q9GZQ3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COMMD5Q9GZQ3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COMMD5Q9GZQ3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COMMD5Q9GZQ3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COMMD5Q9GZQ3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COMMD5Q9GZQ3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COMMD5Q9GZQ3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COMMD5Q9GZQ3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COMMD5Q9GZQ3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COMMD5Q9GZQ3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COMMD5Q9GZQ3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COMMD5Q9GZQ3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COMMD5Q9GZQ3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COMMD5Q9GZQ3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COMMD5Q9GZQ3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COMMD5Q9GZQ3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COMMD5Q9GZQ3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
COMMD5Q9GZQ3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COMMD5Q9GZQ3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COMMD5Q9GZQ3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms