Protein–RNA interactions for Protein: Q9C098

DCLK3, Serine/threonine-protein kinase DCLK3, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK3Q9C098 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DCLK3Q9C098 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DCLK3Q9C098 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DCLK3Q9C098 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
DCLK3Q9C098 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DCLK3Q9C098 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DCLK3Q9C098 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DCLK3Q9C098 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
DCLK3Q9C098 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DCLK3Q9C098 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
DCLK3Q9C098 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DCLK3Q9C098 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DCLK3Q9C098 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DCLK3Q9C098 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DCLK3Q9C098 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DCLK3Q9C098 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
DCLK3Q9C098 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DCLK3Q9C098 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
DCLK3Q9C098 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DCLK3Q9C098 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DCLK3Q9C098 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DCLK3Q9C098 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DCLK3Q9C098 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DCLK3Q9C098 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DCLK3Q9C098 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DCLK3Q9C098 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DCLK3Q9C098 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DCLK3Q9C098 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DCLK3Q9C098 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DCLK3Q9C098 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DCLK3Q9C098 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DCLK3Q9C098 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DCLK3Q9C098 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DCLK3Q9C098 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DCLK3Q9C098 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DCLK3Q9C098 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
DCLK3Q9C098 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DCLK3Q9C098 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DCLK3Q9C098 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DCLK3Q9C098 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DCLK3Q9C098 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DCLK3Q9C098 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DCLK3Q9C098 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DCLK3Q9C098 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
DCLK3Q9C098 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DCLK3Q9C098 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DCLK3Q9C098 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DCLK3Q9C098 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DCLK3Q9C098 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DCLK3Q9C098 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DCLK3Q9C098 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DCLK3Q9C098 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DCLK3Q9C098 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DCLK3Q9C098 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
DCLK3Q9C098 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DCLK3Q9C098 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
DCLK3Q9C098 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DCLK3Q9C098 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DCLK3Q9C098 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
DCLK3Q9C098 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DCLK3Q9C098 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
DCLK3Q9C098 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
DCLK3Q9C098 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DCLK3Q9C098 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DCLK3Q9C098 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DCLK3Q9C098 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DCLK3Q9C098 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DCLK3Q9C098 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DCLK3Q9C098 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DCLK3Q9C098 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DCLK3Q9C098 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DCLK3Q9C098 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DCLK3Q9C098 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DCLK3Q9C098 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DCLK3Q9C098 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DCLK3Q9C098 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DCLK3Q9C098 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DCLK3Q9C098 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DCLK3Q9C098 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DCLK3Q9C098 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DCLK3Q9C098 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DCLK3Q9C098 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DCLK3Q9C098 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DCLK3Q9C098 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DCLK3Q9C098 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DCLK3Q9C098 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DCLK3Q9C098 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DCLK3Q9C098 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DCLK3Q9C098 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DCLK3Q9C098 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DCLK3Q9C098 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DCLK3Q9C098 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DCLK3Q9C098 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DCLK3Q9C098 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DCLK3Q9C098 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DCLK3Q9C098 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DCLK3Q9C098 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DCLK3Q9C098 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DCLK3Q9C098 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DCLK3Q9C098 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms