Protein–RNA interactions for Protein: Q9C093

SPEF2, Sperm flagellar protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEF2Q9C093 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SPEF2Q9C093 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SPEF2Q9C093 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SPEF2Q9C093 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SPEF2Q9C093 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SPEF2Q9C093 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SPEF2Q9C093 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SPEF2Q9C093 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SPEF2Q9C093 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SPEF2Q9C093 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SPEF2Q9C093 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
SPEF2Q9C093 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SPEF2Q9C093 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SPEF2Q9C093 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SPEF2Q9C093 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SPEF2Q9C093 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SPEF2Q9C093 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SPEF2Q9C093 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SPEF2Q9C093 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SPEF2Q9C093 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SPEF2Q9C093 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SPEF2Q9C093 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SPEF2Q9C093 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SPEF2Q9C093 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SPEF2Q9C093 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SPEF2Q9C093 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SPEF2Q9C093 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SPEF2Q9C093 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
SPEF2Q9C093 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SPEF2Q9C093 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SPEF2Q9C093 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SPEF2Q9C093 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SPEF2Q9C093 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SPEF2Q9C093 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SPEF2Q9C093 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SPEF2Q9C093 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SPEF2Q9C093 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SPEF2Q9C093 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SPEF2Q9C093 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SPEF2Q9C093 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SPEF2Q9C093 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SPEF2Q9C093 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SPEF2Q9C093 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SPEF2Q9C093 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SPEF2Q9C093 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SPEF2Q9C093 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SPEF2Q9C093 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
SPEF2Q9C093 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SPEF2Q9C093 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
SPEF2Q9C093 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
SPEF2Q9C093 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
SPEF2Q9C093 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SPEF2Q9C093 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SPEF2Q9C093 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SPEF2Q9C093 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SPEF2Q9C093 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
SPEF2Q9C093 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SPEF2Q9C093 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SPEF2Q9C093 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC30■■■□□ 2.39
SPEF2Q9C093 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SPEF2Q9C093 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SPEF2Q9C093 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SPEF2Q9C093 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SPEF2Q9C093 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SPEF2Q9C093 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SPEF2Q9C093 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SPEF2Q9C093 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
SPEF2Q9C093 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SPEF2Q9C093 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SPEF2Q9C093 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SPEF2Q9C093 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SPEF2Q9C093 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SPEF2Q9C093 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SPEF2Q9C093 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SPEF2Q9C093 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SPEF2Q9C093 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SPEF2Q9C093 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SPEF2Q9C093 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SPEF2Q9C093 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SPEF2Q9C093 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SPEF2Q9C093 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SPEF2Q9C093 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SPEF2Q9C093 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
SPEF2Q9C093 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SPEF2Q9C093 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SPEF2Q9C093 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
SPEF2Q9C093 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SPEF2Q9C093 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SPEF2Q9C093 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SPEF2Q9C093 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SPEF2Q9C093 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SPEF2Q9C093 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SPEF2Q9C093 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SPEF2Q9C093 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SPEF2Q9C093 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SPEF2Q9C093 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SPEF2Q9C093 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SPEF2Q9C093 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SPEF2Q9C093 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SPEF2Q9C093 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms