Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
SYCP2Q9BX26 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SYCP2Q9BX26 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SYCP2Q9BX26 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
SYCP2Q9BX26 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
SYCP2Q9BX26 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
SYCP2Q9BX26 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
SYCP2Q9BX26 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
SYCP2Q9BX26 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
SYCP2Q9BX26 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
SYCP2Q9BX26 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
SYCP2Q9BX26 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
SYCP2Q9BX26 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
SYCP2Q9BX26 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
SYCP2Q9BX26 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
SYCP2Q9BX26 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
SYCP2Q9BX26 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
SYCP2Q9BX26 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
SYCP2Q9BX26 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
SYCP2Q9BX26 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
SYCP2Q9BX26 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
SYCP2Q9BX26 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
SYCP2Q9BX26 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
SYCP2Q9BX26 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
SYCP2Q9BX26 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
SYCP2Q9BX26 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
SYCP2Q9BX26 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
SYCP2Q9BX26 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
SYCP2Q9BX26 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
SYCP2Q9BX26 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
SYCP2Q9BX26 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
SYCP2Q9BX26 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
SYCP2Q9BX26 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
SYCP2Q9BX26 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
SYCP2Q9BX26 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
SYCP2Q9BX26 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
SYCP2Q9BX26 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
SYCP2Q9BX26 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
SYCP2Q9BX26 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
SYCP2Q9BX26 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
SYCP2Q9BX26 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
SYCP2Q9BX26 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
SYCP2Q9BX26 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
SYCP2Q9BX26 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
SYCP2Q9BX26 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
SYCP2Q9BX26 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
SYCP2Q9BX26 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
SYCP2Q9BX26 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.5
SYCP2Q9BX26 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.5
SYCP2Q9BX26 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
SYCP2Q9BX26 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
SYCP2Q9BX26 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
SYCP2Q9BX26 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
SYCP2Q9BX26 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
SYCP2Q9BX26 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
SYCP2Q9BX26 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
SYCP2Q9BX26 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
SYCP2Q9BX26 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
SYCP2Q9BX26 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
SYCP2Q9BX26 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC36.92■■■■□ 3.5
SYCP2Q9BX26 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
SYCP2Q9BX26 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
SYCP2Q9BX26 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
SYCP2Q9BX26 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
SYCP2Q9BX26 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
SYCP2Q9BX26 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
SYCP2Q9BX26 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
SYCP2Q9BX26 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
SYCP2Q9BX26 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC36.89■■■■□ 3.5
SYCP2Q9BX26 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
SYCP2Q9BX26 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
SYCP2Q9BX26 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
SYCP2Q9BX26 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
SYCP2Q9BX26 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
SYCP2Q9BX26 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
SYCP2Q9BX26 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
SYCP2Q9BX26 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
SYCP2Q9BX26 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
SYCP2Q9BX26 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
SYCP2Q9BX26 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
SYCP2Q9BX26 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
SYCP2Q9BX26 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
SYCP2Q9BX26 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
SYCP2Q9BX26 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
SYCP2Q9BX26 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
SYCP2Q9BX26 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
SYCP2Q9BX26 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
SYCP2Q9BX26 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
SYCP2Q9BX26 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
SYCP2Q9BX26 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.48
SYCP2Q9BX26 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
SYCP2Q9BX26 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
SYCP2Q9BX26 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
SYCP2Q9BX26 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
SYCP2Q9BX26 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
SYCP2Q9BX26 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
SYCP2Q9BX26 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
SYCP2Q9BX26 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
SYCP2Q9BX26 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
SYCP2Q9BX26 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms