Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
H2AFJQ9BTM1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
H2AFJQ9BTM1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
H2AFJQ9BTM1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
H2AFJQ9BTM1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
H2AFJQ9BTM1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
H2AFJQ9BTM1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
H2AFJQ9BTM1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
H2AFJQ9BTM1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H2AFJQ9BTM1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H2AFJQ9BTM1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
H2AFJQ9BTM1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H2AFJQ9BTM1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
H2AFJQ9BTM1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H2AFJQ9BTM1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H2AFJQ9BTM1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H2AFJQ9BTM1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2AFJQ9BTM1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2AFJQ9BTM1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2AFJQ9BTM1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2AFJQ9BTM1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2AFJQ9BTM1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2AFJQ9BTM1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2AFJQ9BTM1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2AFJQ9BTM1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
H2AFJQ9BTM1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
H2AFJQ9BTM1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
H2AFJQ9BTM1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
H2AFJQ9BTM1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
H2AFJQ9BTM1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
H2AFJQ9BTM1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
H2AFJQ9BTM1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
H2AFJQ9BTM1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
H2AFJQ9BTM1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
H2AFJQ9BTM1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
H2AFJQ9BTM1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H2AFJQ9BTM1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
H2AFJQ9BTM1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
H2AFJQ9BTM1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
H2AFJQ9BTM1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
H2AFJQ9BTM1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
H2AFJQ9BTM1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
H2AFJQ9BTM1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
H2AFJQ9BTM1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
H2AFJQ9BTM1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
H2AFJQ9BTM1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H2AFJQ9BTM1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H2AFJQ9BTM1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
H2AFJQ9BTM1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H2AFJQ9BTM1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2AFJQ9BTM1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2AFJQ9BTM1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2AFJQ9BTM1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2AFJQ9BTM1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2AFJQ9BTM1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2AFJQ9BTM1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2AFJQ9BTM1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
H2AFJQ9BTM1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
H2AFJQ9BTM1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
H2AFJQ9BTM1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
H2AFJQ9BTM1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
H2AFJQ9BTM1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
H2AFJQ9BTM1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
H2AFJQ9BTM1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
H2AFJQ9BTM1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
H2AFJQ9BTM1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
H2AFJQ9BTM1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
H2AFJQ9BTM1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
H2AFJQ9BTM1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
H2AFJQ9BTM1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H2AFJQ9BTM1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H2AFJQ9BTM1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H2AFJQ9BTM1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
H2AFJQ9BTM1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
H2AFJQ9BTM1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
H2AFJQ9BTM1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
H2AFJQ9BTM1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
H2AFJQ9BTM1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
H2AFJQ9BTM1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
H2AFJQ9BTM1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
H2AFJQ9BTM1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2AFJQ9BTM1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2AFJQ9BTM1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2AFJQ9BTM1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2AFJQ9BTM1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2AFJQ9BTM1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2AFJQ9BTM1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H2AFJQ9BTM1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
H2AFJQ9BTM1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2AFJQ9BTM1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2AFJQ9BTM1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2AFJQ9BTM1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2AFJQ9BTM1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
H2AFJQ9BTM1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2AFJQ9BTM1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2AFJQ9BTM1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2AFJQ9BTM1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2AFJQ9BTM1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H2AFJQ9BTM1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2AFJQ9BTM1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms