Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV3

SLC50A1, Sugar transporter SWEET1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC50A1Q9BRV3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC50A1Q9BRV3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC50A1Q9BRV3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC50A1Q9BRV3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC50A1Q9BRV3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC50A1Q9BRV3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC50A1Q9BRV3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC50A1Q9BRV3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC50A1Q9BRV3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC50A1Q9BRV3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC50A1Q9BRV3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC50A1Q9BRV3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC50A1Q9BRV3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC50A1Q9BRV3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC50A1Q9BRV3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC50A1Q9BRV3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC50A1Q9BRV3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC50A1Q9BRV3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC50A1Q9BRV3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC50A1Q9BRV3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC50A1Q9BRV3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC50A1Q9BRV3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC50A1Q9BRV3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC50A1Q9BRV3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC50A1Q9BRV3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC50A1Q9BRV3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC50A1Q9BRV3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC50A1Q9BRV3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC50A1Q9BRV3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC50A1Q9BRV3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC50A1Q9BRV3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC50A1Q9BRV3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC50A1Q9BRV3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC50A1Q9BRV3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC50A1Q9BRV3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC50A1Q9BRV3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC50A1Q9BRV3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC50A1Q9BRV3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC50A1Q9BRV3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC50A1Q9BRV3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC50A1Q9BRV3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC50A1Q9BRV3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC50A1Q9BRV3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC50A1Q9BRV3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC50A1Q9BRV3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC50A1Q9BRV3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC50A1Q9BRV3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC50A1Q9BRV3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC50A1Q9BRV3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC50A1Q9BRV3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC50A1Q9BRV3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC50A1Q9BRV3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC50A1Q9BRV3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC50A1Q9BRV3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC50A1Q9BRV3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC50A1Q9BRV3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC50A1Q9BRV3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC50A1Q9BRV3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC50A1Q9BRV3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC50A1Q9BRV3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC50A1Q9BRV3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC50A1Q9BRV3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC50A1Q9BRV3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC50A1Q9BRV3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC50A1Q9BRV3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC50A1Q9BRV3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC50A1Q9BRV3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC50A1Q9BRV3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC50A1Q9BRV3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC50A1Q9BRV3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC50A1Q9BRV3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC50A1Q9BRV3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC50A1Q9BRV3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC50A1Q9BRV3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC50A1Q9BRV3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC50A1Q9BRV3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC50A1Q9BRV3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC50A1Q9BRV3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC50A1Q9BRV3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC50A1Q9BRV3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC50A1Q9BRV3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC50A1Q9BRV3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC50A1Q9BRV3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC50A1Q9BRV3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC50A1Q9BRV3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC50A1Q9BRV3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC50A1Q9BRV3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC50A1Q9BRV3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC50A1Q9BRV3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC50A1Q9BRV3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC50A1Q9BRV3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC50A1Q9BRV3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC50A1Q9BRV3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC50A1Q9BRV3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC50A1Q9BRV3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC50A1Q9BRV3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC50A1Q9BRV3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC50A1Q9BRV3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC50A1Q9BRV3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC50A1Q9BRV3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms