Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRT9

GINS4, DNA replication complex GINS protein SLD5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS4Q9BRT9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GINS4Q9BRT9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GINS4Q9BRT9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GINS4Q9BRT9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GINS4Q9BRT9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GINS4Q9BRT9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GINS4Q9BRT9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GINS4Q9BRT9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GINS4Q9BRT9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GINS4Q9BRT9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GINS4Q9BRT9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GINS4Q9BRT9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GINS4Q9BRT9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GINS4Q9BRT9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GINS4Q9BRT9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GINS4Q9BRT9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GINS4Q9BRT9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GINS4Q9BRT9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GINS4Q9BRT9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GINS4Q9BRT9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GINS4Q9BRT9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GINS4Q9BRT9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GINS4Q9BRT9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GINS4Q9BRT9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GINS4Q9BRT9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GINS4Q9BRT9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GINS4Q9BRT9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GINS4Q9BRT9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GINS4Q9BRT9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GINS4Q9BRT9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GINS4Q9BRT9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GINS4Q9BRT9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GINS4Q9BRT9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GINS4Q9BRT9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GINS4Q9BRT9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GINS4Q9BRT9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GINS4Q9BRT9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GINS4Q9BRT9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GINS4Q9BRT9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GINS4Q9BRT9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
GINS4Q9BRT9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GINS4Q9BRT9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GINS4Q9BRT9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GINS4Q9BRT9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GINS4Q9BRT9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GINS4Q9BRT9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GINS4Q9BRT9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GINS4Q9BRT9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GINS4Q9BRT9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GINS4Q9BRT9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GINS4Q9BRT9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GINS4Q9BRT9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GINS4Q9BRT9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GINS4Q9BRT9 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GINS4Q9BRT9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
GINS4Q9BRT9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
GINS4Q9BRT9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GINS4Q9BRT9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GINS4Q9BRT9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GINS4Q9BRT9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GINS4Q9BRT9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GINS4Q9BRT9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GINS4Q9BRT9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GINS4Q9BRT9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GINS4Q9BRT9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GINS4Q9BRT9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GINS4Q9BRT9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GINS4Q9BRT9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GINS4Q9BRT9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
GINS4Q9BRT9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GINS4Q9BRT9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GINS4Q9BRT9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GINS4Q9BRT9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GINS4Q9BRT9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GINS4Q9BRT9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GINS4Q9BRT9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GINS4Q9BRT9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GINS4Q9BRT9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GINS4Q9BRT9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GINS4Q9BRT9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GINS4Q9BRT9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GINS4Q9BRT9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GINS4Q9BRT9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GINS4Q9BRT9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GINS4Q9BRT9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GINS4Q9BRT9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GINS4Q9BRT9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GINS4Q9BRT9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GINS4Q9BRT9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GINS4Q9BRT9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GINS4Q9BRT9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GINS4Q9BRT9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GINS4Q9BRT9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GINS4Q9BRT9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GINS4Q9BRT9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GINS4Q9BRT9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
GINS4Q9BRT9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GINS4Q9BRT9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GINS4Q9BRT9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GINS4Q9BRT9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.4 ms