Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MESP1Q9BRJ9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MESP1Q9BRJ9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MESP1Q9BRJ9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MESP1Q9BRJ9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MESP1Q9BRJ9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MESP1Q9BRJ9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MESP1Q9BRJ9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MESP1Q9BRJ9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MESP1Q9BRJ9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MESP1Q9BRJ9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MESP1Q9BRJ9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MESP1Q9BRJ9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MESP1Q9BRJ9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MESP1Q9BRJ9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MESP1Q9BRJ9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MESP1Q9BRJ9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MESP1Q9BRJ9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MESP1Q9BRJ9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MESP1Q9BRJ9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MESP1Q9BRJ9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MESP1Q9BRJ9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MESP1Q9BRJ9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MESP1Q9BRJ9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MESP1Q9BRJ9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MESP1Q9BRJ9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MESP1Q9BRJ9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MESP1Q9BRJ9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MESP1Q9BRJ9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MESP1Q9BRJ9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MESP1Q9BRJ9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MESP1Q9BRJ9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MESP1Q9BRJ9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MESP1Q9BRJ9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MESP1Q9BRJ9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MESP1Q9BRJ9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MESP1Q9BRJ9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MESP1Q9BRJ9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MESP1Q9BRJ9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MESP1Q9BRJ9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MESP1Q9BRJ9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MESP1Q9BRJ9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MESP1Q9BRJ9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MESP1Q9BRJ9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MESP1Q9BRJ9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MESP1Q9BRJ9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MESP1Q9BRJ9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MESP1Q9BRJ9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MESP1Q9BRJ9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MESP1Q9BRJ9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MESP1Q9BRJ9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MESP1Q9BRJ9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MESP1Q9BRJ9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MESP1Q9BRJ9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MESP1Q9BRJ9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MESP1Q9BRJ9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MESP1Q9BRJ9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MESP1Q9BRJ9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MESP1Q9BRJ9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MESP1Q9BRJ9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MESP1Q9BRJ9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MESP1Q9BRJ9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MESP1Q9BRJ9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MESP1Q9BRJ9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MESP1Q9BRJ9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MESP1Q9BRJ9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MESP1Q9BRJ9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MESP1Q9BRJ9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MESP1Q9BRJ9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MESP1Q9BRJ9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MESP1Q9BRJ9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MESP1Q9BRJ9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MESP1Q9BRJ9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MESP1Q9BRJ9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MESP1Q9BRJ9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MESP1Q9BRJ9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MESP1Q9BRJ9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MESP1Q9BRJ9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MESP1Q9BRJ9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MESP1Q9BRJ9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MESP1Q9BRJ9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MESP1Q9BRJ9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MESP1Q9BRJ9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MESP1Q9BRJ9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MESP1Q9BRJ9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MESP1Q9BRJ9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MESP1Q9BRJ9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MESP1Q9BRJ9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MESP1Q9BRJ9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MESP1Q9BRJ9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MESP1Q9BRJ9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MESP1Q9BRJ9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MESP1Q9BRJ9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MESP1Q9BRJ9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MESP1Q9BRJ9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MESP1Q9BRJ9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MESP1Q9BRJ9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MESP1Q9BRJ9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MESP1Q9BRJ9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MESP1Q9BRJ9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms