Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG2

SH2D3A, SH2 domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D3AQ9BRG2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SH2D3AQ9BRG2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SH2D3AQ9BRG2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SH2D3AQ9BRG2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SH2D3AQ9BRG2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SH2D3AQ9BRG2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SH2D3AQ9BRG2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SH2D3AQ9BRG2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SH2D3AQ9BRG2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SH2D3AQ9BRG2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SH2D3AQ9BRG2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SH2D3AQ9BRG2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SH2D3AQ9BRG2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SH2D3AQ9BRG2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SH2D3AQ9BRG2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SH2D3AQ9BRG2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SH2D3AQ9BRG2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SH2D3AQ9BRG2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SH2D3AQ9BRG2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SH2D3AQ9BRG2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SH2D3AQ9BRG2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SH2D3AQ9BRG2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SH2D3AQ9BRG2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SH2D3AQ9BRG2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SH2D3AQ9BRG2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SH2D3AQ9BRG2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SH2D3AQ9BRG2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SH2D3AQ9BRG2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27■■□□□ 1.91
SH2D3AQ9BRG2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SH2D3AQ9BRG2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SH2D3AQ9BRG2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SH2D3AQ9BRG2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SH2D3AQ9BRG2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SH2D3AQ9BRG2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SH2D3AQ9BRG2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SH2D3AQ9BRG2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SH2D3AQ9BRG2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SH2D3AQ9BRG2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SH2D3AQ9BRG2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SH2D3AQ9BRG2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SH2D3AQ9BRG2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SH2D3AQ9BRG2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SH2D3AQ9BRG2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SH2D3AQ9BRG2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SH2D3AQ9BRG2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SH2D3AQ9BRG2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SH2D3AQ9BRG2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SH2D3AQ9BRG2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SH2D3AQ9BRG2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SH2D3AQ9BRG2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SH2D3AQ9BRG2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SH2D3AQ9BRG2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SH2D3AQ9BRG2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SH2D3AQ9BRG2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SH2D3AQ9BRG2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SH2D3AQ9BRG2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SH2D3AQ9BRG2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SH2D3AQ9BRG2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SH2D3AQ9BRG2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SH2D3AQ9BRG2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SH2D3AQ9BRG2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SH2D3AQ9BRG2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SH2D3AQ9BRG2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SH2D3AQ9BRG2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SH2D3AQ9BRG2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SH2D3AQ9BRG2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SH2D3AQ9BRG2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SH2D3AQ9BRG2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SH2D3AQ9BRG2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SH2D3AQ9BRG2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SH2D3AQ9BRG2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SH2D3AQ9BRG2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SH2D3AQ9BRG2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SH2D3AQ9BRG2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SH2D3AQ9BRG2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SH2D3AQ9BRG2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SH2D3AQ9BRG2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SH2D3AQ9BRG2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SH2D3AQ9BRG2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SH2D3AQ9BRG2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SH2D3AQ9BRG2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SH2D3AQ9BRG2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SH2D3AQ9BRG2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SH2D3AQ9BRG2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SH2D3AQ9BRG2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SH2D3AQ9BRG2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SH2D3AQ9BRG2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SH2D3AQ9BRG2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SH2D3AQ9BRG2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SH2D3AQ9BRG2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SH2D3AQ9BRG2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SH2D3AQ9BRG2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SH2D3AQ9BRG2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SH2D3AQ9BRG2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SH2D3AQ9BRG2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SH2D3AQ9BRG2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SH2D3AQ9BRG2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SH2D3AQ9BRG2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SH2D3AQ9BRG2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SH2D3AQ9BRG2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms