Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG1

VPS25, Vacuolar protein-sorting-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS25Q9BRG1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VPS25Q9BRG1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VPS25Q9BRG1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VPS25Q9BRG1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VPS25Q9BRG1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VPS25Q9BRG1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
VPS25Q9BRG1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VPS25Q9BRG1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VPS25Q9BRG1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VPS25Q9BRG1 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VPS25Q9BRG1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VPS25Q9BRG1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VPS25Q9BRG1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VPS25Q9BRG1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VPS25Q9BRG1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VPS25Q9BRG1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VPS25Q9BRG1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VPS25Q9BRG1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VPS25Q9BRG1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPS25Q9BRG1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPS25Q9BRG1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPS25Q9BRG1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPS25Q9BRG1 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPS25Q9BRG1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPS25Q9BRG1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPS25Q9BRG1 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPS25Q9BRG1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPS25Q9BRG1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPS25Q9BRG1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPS25Q9BRG1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPS25Q9BRG1 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPS25Q9BRG1 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPS25Q9BRG1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPS25Q9BRG1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VPS25Q9BRG1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VPS25Q9BRG1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VPS25Q9BRG1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VPS25Q9BRG1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VPS25Q9BRG1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VPS25Q9BRG1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VPS25Q9BRG1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VPS25Q9BRG1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VPS25Q9BRG1 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VPS25Q9BRG1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VPS25Q9BRG1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VPS25Q9BRG1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VPS25Q9BRG1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VPS25Q9BRG1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VPS25Q9BRG1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VPS25Q9BRG1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VPS25Q9BRG1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VPS25Q9BRG1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VPS25Q9BRG1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VPS25Q9BRG1 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VPS25Q9BRG1 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VPS25Q9BRG1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VPS25Q9BRG1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VPS25Q9BRG1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VPS25Q9BRG1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VPS25Q9BRG1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VPS25Q9BRG1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VPS25Q9BRG1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
VPS25Q9BRG1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
VPS25Q9BRG1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VPS25Q9BRG1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VPS25Q9BRG1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VPS25Q9BRG1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VPS25Q9BRG1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VPS25Q9BRG1 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VPS25Q9BRG1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VPS25Q9BRG1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VPS25Q9BRG1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VPS25Q9BRG1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VPS25Q9BRG1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VPS25Q9BRG1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VPS25Q9BRG1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VPS25Q9BRG1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VPS25Q9BRG1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VPS25Q9BRG1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VPS25Q9BRG1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VPS25Q9BRG1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VPS25Q9BRG1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VPS25Q9BRG1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VPS25Q9BRG1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VPS25Q9BRG1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VPS25Q9BRG1 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VPS25Q9BRG1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VPS25Q9BRG1 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VPS25Q9BRG1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VPS25Q9BRG1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VPS25Q9BRG1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VPS25Q9BRG1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VPS25Q9BRG1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VPS25Q9BRG1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VPS25Q9BRG1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VPS25Q9BRG1 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VPS25Q9BRG1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VPS25Q9BRG1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VPS25Q9BRG1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
VPS25Q9BRG1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.3 ms