Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SGIP1Q9BQI5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SGIP1Q9BQI5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SGIP1Q9BQI5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SGIP1Q9BQI5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SGIP1Q9BQI5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SGIP1Q9BQI5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
SGIP1Q9BQI5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SGIP1Q9BQI5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SGIP1Q9BQI5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SGIP1Q9BQI5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SGIP1Q9BQI5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SGIP1Q9BQI5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SGIP1Q9BQI5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SGIP1Q9BQI5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SGIP1Q9BQI5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SGIP1Q9BQI5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SGIP1Q9BQI5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SGIP1Q9BQI5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SGIP1Q9BQI5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SGIP1Q9BQI5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SGIP1Q9BQI5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SGIP1Q9BQI5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SGIP1Q9BQI5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SGIP1Q9BQI5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SGIP1Q9BQI5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SGIP1Q9BQI5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SGIP1Q9BQI5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SGIP1Q9BQI5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SGIP1Q9BQI5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SGIP1Q9BQI5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SGIP1Q9BQI5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SGIP1Q9BQI5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SGIP1Q9BQI5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SGIP1Q9BQI5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SGIP1Q9BQI5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SGIP1Q9BQI5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SGIP1Q9BQI5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
SGIP1Q9BQI5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SGIP1Q9BQI5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SGIP1Q9BQI5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SGIP1Q9BQI5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SGIP1Q9BQI5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SGIP1Q9BQI5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SGIP1Q9BQI5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SGIP1Q9BQI5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SGIP1Q9BQI5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SGIP1Q9BQI5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SGIP1Q9BQI5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
SGIP1Q9BQI5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
SGIP1Q9BQI5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
SGIP1Q9BQI5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SGIP1Q9BQI5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
SGIP1Q9BQI5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SGIP1Q9BQI5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SGIP1Q9BQI5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SGIP1Q9BQI5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SGIP1Q9BQI5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
SGIP1Q9BQI5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SGIP1Q9BQI5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SGIP1Q9BQI5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SGIP1Q9BQI5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
SGIP1Q9BQI5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SGIP1Q9BQI5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SGIP1Q9BQI5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
SGIP1Q9BQI5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SGIP1Q9BQI5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SGIP1Q9BQI5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SGIP1Q9BQI5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SGIP1Q9BQI5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SGIP1Q9BQI5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SGIP1Q9BQI5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SGIP1Q9BQI5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
SGIP1Q9BQI5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
SGIP1Q9BQI5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SGIP1Q9BQI5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
SGIP1Q9BQI5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SGIP1Q9BQI5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SGIP1Q9BQI5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
SGIP1Q9BQI5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
SGIP1Q9BQI5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SGIP1Q9BQI5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
SGIP1Q9BQI5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
SGIP1Q9BQI5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SGIP1Q9BQI5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SGIP1Q9BQI5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SGIP1Q9BQI5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SGIP1Q9BQI5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SGIP1Q9BQI5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SGIP1Q9BQI5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SGIP1Q9BQI5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SGIP1Q9BQI5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SGIP1Q9BQI5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SGIP1Q9BQI5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SGIP1Q9BQI5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SGIP1Q9BQI5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SGIP1Q9BQI5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SGIP1Q9BQI5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SGIP1Q9BQI5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SGIP1Q9BQI5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms