Protein–RNA interactions for Protein: Q99618

CDCA3, Cell division cycle-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3Q99618 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDCA3Q99618 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDCA3Q99618 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDCA3Q99618 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDCA3Q99618 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDCA3Q99618 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDCA3Q99618 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CDCA3Q99618 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CDCA3Q99618 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDCA3Q99618 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDCA3Q99618 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDCA3Q99618 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDCA3Q99618 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDCA3Q99618 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDCA3Q99618 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDCA3Q99618 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDCA3Q99618 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDCA3Q99618 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDCA3Q99618 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDCA3Q99618 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDCA3Q99618 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDCA3Q99618 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDCA3Q99618 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDCA3Q99618 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDCA3Q99618 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CDCA3Q99618 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDCA3Q99618 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDCA3Q99618 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDCA3Q99618 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDCA3Q99618 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDCA3Q99618 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDCA3Q99618 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDCA3Q99618 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDCA3Q99618 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDCA3Q99618 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDCA3Q99618 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDCA3Q99618 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDCA3Q99618 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDCA3Q99618 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDCA3Q99618 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDCA3Q99618 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDCA3Q99618 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDCA3Q99618 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDCA3Q99618 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDCA3Q99618 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDCA3Q99618 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDCA3Q99618 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDCA3Q99618 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDCA3Q99618 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDCA3Q99618 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CDCA3Q99618 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDCA3Q99618 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CDCA3Q99618 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDCA3Q99618 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDCA3Q99618 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CDCA3Q99618 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDCA3Q99618 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDCA3Q99618 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDCA3Q99618 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDCA3Q99618 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDCA3Q99618 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDCA3Q99618 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDCA3Q99618 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDCA3Q99618 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDCA3Q99618 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDCA3Q99618 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDCA3Q99618 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDCA3Q99618 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDCA3Q99618 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDCA3Q99618 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CDCA3Q99618 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CDCA3Q99618 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDCA3Q99618 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDCA3Q99618 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDCA3Q99618 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDCA3Q99618 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDCA3Q99618 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CDCA3Q99618 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDCA3Q99618 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CDCA3Q99618 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDCA3Q99618 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDCA3Q99618 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDCA3Q99618 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDCA3Q99618 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDCA3Q99618 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDCA3Q99618 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDCA3Q99618 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDCA3Q99618 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDCA3Q99618 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDCA3Q99618 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDCA3Q99618 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDCA3Q99618 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDCA3Q99618 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDCA3Q99618 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDCA3Q99618 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDCA3Q99618 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDCA3Q99618 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDCA3Q99618 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CDCA3Q99618 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDCA3Q99618 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms