Protein–RNA interactions for Protein: Q96T25

ZIC5, Zinc finger protein ZIC 5, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC5Q96T25 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZIC5Q96T25 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZIC5Q96T25 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZIC5Q96T25 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZIC5Q96T25 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZIC5Q96T25 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZIC5Q96T25 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZIC5Q96T25 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZIC5Q96T25 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZIC5Q96T25 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZIC5Q96T25 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZIC5Q96T25 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ZIC5Q96T25 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZIC5Q96T25 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZIC5Q96T25 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZIC5Q96T25 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ZIC5Q96T25 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZIC5Q96T25 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ZIC5Q96T25 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ZIC5Q96T25 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZIC5Q96T25 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZIC5Q96T25 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZIC5Q96T25 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ZIC5Q96T25 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZIC5Q96T25 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZIC5Q96T25 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZIC5Q96T25 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZIC5Q96T25 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZIC5Q96T25 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZIC5Q96T25 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZIC5Q96T25 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZIC5Q96T25 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZIC5Q96T25 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZIC5Q96T25 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZIC5Q96T25 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZIC5Q96T25 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZIC5Q96T25 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZIC5Q96T25 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZIC5Q96T25 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZIC5Q96T25 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZIC5Q96T25 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZIC5Q96T25 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ZIC5Q96T25 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ZIC5Q96T25 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZIC5Q96T25 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZIC5Q96T25 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZIC5Q96T25 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZIC5Q96T25 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZIC5Q96T25 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZIC5Q96T25 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZIC5Q96T25 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZIC5Q96T25 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZIC5Q96T25 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZIC5Q96T25 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ZIC5Q96T25 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZIC5Q96T25 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZIC5Q96T25 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ZIC5Q96T25 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ZIC5Q96T25 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZIC5Q96T25 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZIC5Q96T25 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZIC5Q96T25 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZIC5Q96T25 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZIC5Q96T25 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZIC5Q96T25 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZIC5Q96T25 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZIC5Q96T25 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZIC5Q96T25 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZIC5Q96T25 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ZIC5Q96T25 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZIC5Q96T25 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZIC5Q96T25 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZIC5Q96T25 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ZIC5Q96T25 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZIC5Q96T25 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZIC5Q96T25 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZIC5Q96T25 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZIC5Q96T25 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZIC5Q96T25 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZIC5Q96T25 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZIC5Q96T25 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZIC5Q96T25 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZIC5Q96T25 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZIC5Q96T25 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZIC5Q96T25 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZIC5Q96T25 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZIC5Q96T25 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZIC5Q96T25 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZIC5Q96T25 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZIC5Q96T25 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ZIC5Q96T25 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZIC5Q96T25 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZIC5Q96T25 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZIC5Q96T25 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZIC5Q96T25 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ZIC5Q96T25 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ZIC5Q96T25 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
ZIC5Q96T25 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ZIC5Q96T25 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZIC5Q96T25 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms