Protein–RNA interactions for Protein: Q96SQ7

ATOH8, Protein atonal homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATOH8Q96SQ7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATOH8Q96SQ7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATOH8Q96SQ7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATOH8Q96SQ7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATOH8Q96SQ7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATOH8Q96SQ7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATOH8Q96SQ7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATOH8Q96SQ7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATOH8Q96SQ7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATOH8Q96SQ7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATOH8Q96SQ7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATOH8Q96SQ7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ATOH8Q96SQ7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATOH8Q96SQ7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATOH8Q96SQ7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATOH8Q96SQ7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATOH8Q96SQ7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATOH8Q96SQ7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATOH8Q96SQ7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATOH8Q96SQ7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATOH8Q96SQ7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATOH8Q96SQ7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATOH8Q96SQ7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATOH8Q96SQ7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATOH8Q96SQ7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATOH8Q96SQ7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATOH8Q96SQ7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATOH8Q96SQ7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATOH8Q96SQ7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATOH8Q96SQ7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATOH8Q96SQ7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATOH8Q96SQ7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATOH8Q96SQ7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATOH8Q96SQ7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATOH8Q96SQ7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATOH8Q96SQ7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATOH8Q96SQ7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATOH8Q96SQ7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATOH8Q96SQ7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATOH8Q96SQ7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATOH8Q96SQ7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATOH8Q96SQ7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATOH8Q96SQ7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATOH8Q96SQ7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATOH8Q96SQ7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATOH8Q96SQ7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ATOH8Q96SQ7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATOH8Q96SQ7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATOH8Q96SQ7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATOH8Q96SQ7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ATOH8Q96SQ7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATOH8Q96SQ7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATOH8Q96SQ7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATOH8Q96SQ7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATOH8Q96SQ7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATOH8Q96SQ7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATOH8Q96SQ7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATOH8Q96SQ7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATOH8Q96SQ7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATOH8Q96SQ7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATOH8Q96SQ7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATOH8Q96SQ7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATOH8Q96SQ7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATOH8Q96SQ7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATOH8Q96SQ7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATOH8Q96SQ7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATOH8Q96SQ7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATOH8Q96SQ7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATOH8Q96SQ7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATOH8Q96SQ7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATOH8Q96SQ7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATOH8Q96SQ7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATOH8Q96SQ7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ATOH8Q96SQ7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ATOH8Q96SQ7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATOH8Q96SQ7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATOH8Q96SQ7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATOH8Q96SQ7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATOH8Q96SQ7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATOH8Q96SQ7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATOH8Q96SQ7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATOH8Q96SQ7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATOH8Q96SQ7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATOH8Q96SQ7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATOH8Q96SQ7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATOH8Q96SQ7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATOH8Q96SQ7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATOH8Q96SQ7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATOH8Q96SQ7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATOH8Q96SQ7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATOH8Q96SQ7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATOH8Q96SQ7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATOH8Q96SQ7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATOH8Q96SQ7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATOH8Q96SQ7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATOH8Q96SQ7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATOH8Q96SQ7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATOH8Q96SQ7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATOH8Q96SQ7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATOH8Q96SQ7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 317.7 ms