Protein–RNA interactions for Protein: Q96QE5

TEFM, Transcription elongation factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TEFMQ96QE5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TEFMQ96QE5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TEFMQ96QE5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TEFMQ96QE5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TEFMQ96QE5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TEFMQ96QE5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TEFMQ96QE5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TEFMQ96QE5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TEFMQ96QE5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TEFMQ96QE5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TEFMQ96QE5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TEFMQ96QE5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TEFMQ96QE5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TEFMQ96QE5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TEFMQ96QE5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TEFMQ96QE5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TEFMQ96QE5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TEFMQ96QE5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TEFMQ96QE5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TEFMQ96QE5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TEFMQ96QE5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TEFMQ96QE5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TEFMQ96QE5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TEFMQ96QE5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TEFMQ96QE5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TEFMQ96QE5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TEFMQ96QE5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TEFMQ96QE5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TEFMQ96QE5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TEFMQ96QE5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TEFMQ96QE5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TEFMQ96QE5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TEFMQ96QE5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TEFMQ96QE5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TEFMQ96QE5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TEFMQ96QE5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TEFMQ96QE5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TEFMQ96QE5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TEFMQ96QE5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TEFMQ96QE5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TEFMQ96QE5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TEFMQ96QE5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TEFMQ96QE5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TEFMQ96QE5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TEFMQ96QE5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TEFMQ96QE5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TEFMQ96QE5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TEFMQ96QE5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TEFMQ96QE5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TEFMQ96QE5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TEFMQ96QE5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TEFMQ96QE5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TEFMQ96QE5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TEFMQ96QE5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TEFMQ96QE5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TEFMQ96QE5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TEFMQ96QE5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TEFMQ96QE5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TEFMQ96QE5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TEFMQ96QE5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TEFMQ96QE5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TEFMQ96QE5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TEFMQ96QE5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TEFMQ96QE5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TEFMQ96QE5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TEFMQ96QE5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TEFMQ96QE5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TEFMQ96QE5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TEFMQ96QE5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TEFMQ96QE5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TEFMQ96QE5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TEFMQ96QE5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TEFMQ96QE5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TEFMQ96QE5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TEFMQ96QE5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TEFMQ96QE5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TEFMQ96QE5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TEFMQ96QE5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TEFMQ96QE5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TEFMQ96QE5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TEFMQ96QE5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TEFMQ96QE5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TEFMQ96QE5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TEFMQ96QE5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TEFMQ96QE5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TEFMQ96QE5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TEFMQ96QE5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TEFMQ96QE5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TEFMQ96QE5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TEFMQ96QE5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TEFMQ96QE5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TEFMQ96QE5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TEFMQ96QE5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TEFMQ96QE5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TEFMQ96QE5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TEFMQ96QE5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TEFMQ96QE5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TEFMQ96QE5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TEFMQ96QE5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TEFMQ96QE5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms