Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
ALS2Q96Q42 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ALS2Q96Q42 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
ALS2Q96Q42 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ALS2Q96Q42 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ALS2Q96Q42 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ALS2Q96Q42 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ALS2Q96Q42 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ALS2Q96Q42 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ALS2Q96Q42 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ALS2Q96Q42 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
ALS2Q96Q42 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ALS2Q96Q42 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ALS2Q96Q42 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
ALS2Q96Q42 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ALS2Q96Q42 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ALS2Q96Q42 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ALS2Q96Q42 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ALS2Q96Q42 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
ALS2Q96Q42 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
ALS2Q96Q42 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
ALS2Q96Q42 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
ALS2Q96Q42 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
ALS2Q96Q42 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ALS2Q96Q42 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
ALS2Q96Q42 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ALS2Q96Q42 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ALS2Q96Q42 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ALS2Q96Q42 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ALS2Q96Q42 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ALS2Q96Q42 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ALS2Q96Q42 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ALS2Q96Q42 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ALS2Q96Q42 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ALS2Q96Q42 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ALS2Q96Q42 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ALS2Q96Q42 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ALS2Q96Q42 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ALS2Q96Q42 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ALS2Q96Q42 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ALS2Q96Q42 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ALS2Q96Q42 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ALS2Q96Q42 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ALS2Q96Q42 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ALS2Q96Q42 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ALS2Q96Q42 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ALS2Q96Q42 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ALS2Q96Q42 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ALS2Q96Q42 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ALS2Q96Q42 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ALS2Q96Q42 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ALS2Q96Q42 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
ALS2Q96Q42 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC33.1■■■□□ 2.89
ALS2Q96Q42 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ALS2Q96Q42 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ALS2Q96Q42 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
ALS2Q96Q42 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ALS2Q96Q42 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
ALS2Q96Q42 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ALS2Q96Q42 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ALS2Q96Q42 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ALS2Q96Q42 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ALS2Q96Q42 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ALS2Q96Q42 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ALS2Q96Q42 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
ALS2Q96Q42 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC33.07■■■□□ 2.89
ALS2Q96Q42 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
ALS2Q96Q42 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.89
ALS2Q96Q42 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ALS2Q96Q42 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
ALS2Q96Q42 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
ALS2Q96Q42 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
ALS2Q96Q42 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ALS2Q96Q42 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ALS2Q96Q42 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ALS2Q96Q42 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ALS2Q96Q42 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ALS2Q96Q42 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ALS2Q96Q42 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ALS2Q96Q42 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ALS2Q96Q42 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ALS2Q96Q42 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ALS2Q96Q42 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ALS2Q96Q42 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ALS2Q96Q42 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ALS2Q96Q42 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ALS2Q96Q42 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ALS2Q96Q42 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ALS2Q96Q42 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ALS2Q96Q42 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
ALS2Q96Q42 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
ALS2Q96Q42 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
ALS2Q96Q42 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
ALS2Q96Q42 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ALS2Q96Q42 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ALS2Q96Q42 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
ALS2Q96Q42 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
ALS2Q96Q42 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ALS2Q96Q42 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
ALS2Q96Q42 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms