Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN8

TSSK3, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK3Q96PN8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSSK3Q96PN8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSSK3Q96PN8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSSK3Q96PN8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSSK3Q96PN8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSSK3Q96PN8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSSK3Q96PN8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSSK3Q96PN8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSSK3Q96PN8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSSK3Q96PN8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSSK3Q96PN8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSSK3Q96PN8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSSK3Q96PN8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSSK3Q96PN8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSSK3Q96PN8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TSSK3Q96PN8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSSK3Q96PN8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSSK3Q96PN8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSSK3Q96PN8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSSK3Q96PN8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSSK3Q96PN8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSSK3Q96PN8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSSK3Q96PN8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TSSK3Q96PN8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSSK3Q96PN8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSSK3Q96PN8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSSK3Q96PN8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSSK3Q96PN8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSSK3Q96PN8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSSK3Q96PN8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSSK3Q96PN8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSSK3Q96PN8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSSK3Q96PN8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSSK3Q96PN8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSSK3Q96PN8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TSSK3Q96PN8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSSK3Q96PN8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSSK3Q96PN8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSSK3Q96PN8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSSK3Q96PN8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSSK3Q96PN8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSSK3Q96PN8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSSK3Q96PN8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSSK3Q96PN8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSSK3Q96PN8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSSK3Q96PN8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSSK3Q96PN8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSSK3Q96PN8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSSK3Q96PN8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSSK3Q96PN8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSSK3Q96PN8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSSK3Q96PN8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSSK3Q96PN8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSSK3Q96PN8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSSK3Q96PN8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSSK3Q96PN8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSSK3Q96PN8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSSK3Q96PN8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSSK3Q96PN8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSSK3Q96PN8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSSK3Q96PN8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSSK3Q96PN8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSSK3Q96PN8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSSK3Q96PN8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSSK3Q96PN8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSSK3Q96PN8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSSK3Q96PN8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSSK3Q96PN8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSSK3Q96PN8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSSK3Q96PN8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TSSK3Q96PN8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TSSK3Q96PN8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TSSK3Q96PN8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TSSK3Q96PN8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSSK3Q96PN8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TSSK3Q96PN8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSSK3Q96PN8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSSK3Q96PN8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSSK3Q96PN8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSSK3Q96PN8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TSSK3Q96PN8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSSK3Q96PN8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSSK3Q96PN8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSSK3Q96PN8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSSK3Q96PN8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSSK3Q96PN8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSSK3Q96PN8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSSK3Q96PN8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSSK3Q96PN8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSSK3Q96PN8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSSK3Q96PN8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSSK3Q96PN8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSSK3Q96PN8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSSK3Q96PN8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSSK3Q96PN8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSSK3Q96PN8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSSK3Q96PN8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSSK3Q96PN8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSSK3Q96PN8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSSK3Q96PN8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms