Protein–RNA interactions for Protein: Q96MT4

LINC01600, Uncharacterized protein encoded by LINC01600, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01600Q96MT4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01600Q96MT4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01600Q96MT4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01600Q96MT4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01600Q96MT4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01600Q96MT4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01600Q96MT4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01600Q96MT4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01600Q96MT4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01600Q96MT4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01600Q96MT4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01600Q96MT4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01600Q96MT4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01600Q96MT4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01600Q96MT4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01600Q96MT4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01600Q96MT4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01600Q96MT4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01600Q96MT4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01600Q96MT4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01600Q96MT4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01600Q96MT4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01600Q96MT4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01600Q96MT4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01600Q96MT4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01600Q96MT4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01600Q96MT4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01600Q96MT4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01600Q96MT4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01600Q96MT4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01600Q96MT4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01600Q96MT4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01600Q96MT4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01600Q96MT4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01600Q96MT4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01600Q96MT4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01600Q96MT4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01600Q96MT4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01600Q96MT4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01600Q96MT4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01600Q96MT4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01600Q96MT4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01600Q96MT4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01600Q96MT4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01600Q96MT4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01600Q96MT4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01600Q96MT4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01600Q96MT4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01600Q96MT4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01600Q96MT4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01600Q96MT4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01600Q96MT4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01600Q96MT4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01600Q96MT4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01600Q96MT4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01600Q96MT4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01600Q96MT4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01600Q96MT4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01600Q96MT4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01600Q96MT4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01600Q96MT4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01600Q96MT4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01600Q96MT4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01600Q96MT4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC01600Q96MT4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01600Q96MT4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01600Q96MT4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01600Q96MT4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01600Q96MT4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01600Q96MT4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01600Q96MT4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01600Q96MT4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01600Q96MT4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01600Q96MT4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01600Q96MT4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01600Q96MT4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01600Q96MT4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC01600Q96MT4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01600Q96MT4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01600Q96MT4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01600Q96MT4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01600Q96MT4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01600Q96MT4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01600Q96MT4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01600Q96MT4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01600Q96MT4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01600Q96MT4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01600Q96MT4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01600Q96MT4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01600Q96MT4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC01600Q96MT4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01600Q96MT4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01600Q96MT4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01600Q96MT4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01600Q96MT4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01600Q96MT4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01600Q96MT4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01600Q96MT4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01600Q96MT4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01600Q96MT4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms