Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC114Q96M63 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC114Q96M63 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC114Q96M63 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC114Q96M63 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC114Q96M63 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC114Q96M63 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC114Q96M63 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC114Q96M63 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC114Q96M63 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC114Q96M63 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC114Q96M63 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC114Q96M63 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC114Q96M63 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC114Q96M63 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC114Q96M63 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC114Q96M63 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC114Q96M63 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC114Q96M63 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC114Q96M63 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC114Q96M63 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC114Q96M63 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC114Q96M63 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC114Q96M63 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC114Q96M63 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC114Q96M63 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC114Q96M63 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC114Q96M63 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC114Q96M63 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC114Q96M63 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC114Q96M63 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC114Q96M63 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC114Q96M63 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC114Q96M63 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC114Q96M63 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC114Q96M63 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC114Q96M63 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms