Protein–RNA interactions for Protein: Q96LL4

C8orf48, Uncharacterized protein C8orf48, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf48Q96LL4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C8orf48Q96LL4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C8orf48Q96LL4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
C8orf48Q96LL4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C8orf48Q96LL4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C8orf48Q96LL4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
C8orf48Q96LL4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C8orf48Q96LL4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C8orf48Q96LL4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C8orf48Q96LL4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C8orf48Q96LL4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C8orf48Q96LL4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C8orf48Q96LL4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C8orf48Q96LL4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C8orf48Q96LL4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C8orf48Q96LL4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C8orf48Q96LL4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C8orf48Q96LL4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
C8orf48Q96LL4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
C8orf48Q96LL4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C8orf48Q96LL4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C8orf48Q96LL4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C8orf48Q96LL4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C8orf48Q96LL4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C8orf48Q96LL4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C8orf48Q96LL4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C8orf48Q96LL4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C8orf48Q96LL4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C8orf48Q96LL4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C8orf48Q96LL4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C8orf48Q96LL4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
C8orf48Q96LL4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C8orf48Q96LL4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C8orf48Q96LL4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C8orf48Q96LL4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C8orf48Q96LL4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C8orf48Q96LL4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C8orf48Q96LL4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C8orf48Q96LL4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
C8orf48Q96LL4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C8orf48Q96LL4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
C8orf48Q96LL4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C8orf48Q96LL4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C8orf48Q96LL4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C8orf48Q96LL4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C8orf48Q96LL4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C8orf48Q96LL4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C8orf48Q96LL4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
C8orf48Q96LL4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C8orf48Q96LL4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
C8orf48Q96LL4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C8orf48Q96LL4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C8orf48Q96LL4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C8orf48Q96LL4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C8orf48Q96LL4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C8orf48Q96LL4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C8orf48Q96LL4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C8orf48Q96LL4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C8orf48Q96LL4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
C8orf48Q96LL4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C8orf48Q96LL4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C8orf48Q96LL4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C8orf48Q96LL4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C8orf48Q96LL4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C8orf48Q96LL4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C8orf48Q96LL4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C8orf48Q96LL4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C8orf48Q96LL4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C8orf48Q96LL4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
C8orf48Q96LL4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C8orf48Q96LL4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C8orf48Q96LL4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C8orf48Q96LL4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C8orf48Q96LL4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C8orf48Q96LL4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
C8orf48Q96LL4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C8orf48Q96LL4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C8orf48Q96LL4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C8orf48Q96LL4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C8orf48Q96LL4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C8orf48Q96LL4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C8orf48Q96LL4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C8orf48Q96LL4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C8orf48Q96LL4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C8orf48Q96LL4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C8orf48Q96LL4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C8orf48Q96LL4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C8orf48Q96LL4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C8orf48Q96LL4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C8orf48Q96LL4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
C8orf48Q96LL4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C8orf48Q96LL4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C8orf48Q96LL4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C8orf48Q96LL4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C8orf48Q96LL4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C8orf48Q96LL4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C8orf48Q96LL4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C8orf48Q96LL4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C8orf48Q96LL4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C8orf48Q96LL4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms