Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGCZQ96LD1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGCZQ96LD1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGCZQ96LD1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGCZQ96LD1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGCZQ96LD1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGCZQ96LD1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGCZQ96LD1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGCZQ96LD1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGCZQ96LD1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGCZQ96LD1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGCZQ96LD1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGCZQ96LD1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGCZQ96LD1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGCZQ96LD1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGCZQ96LD1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGCZQ96LD1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SGCZQ96LD1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGCZQ96LD1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGCZQ96LD1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGCZQ96LD1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGCZQ96LD1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGCZQ96LD1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGCZQ96LD1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SGCZQ96LD1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGCZQ96LD1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGCZQ96LD1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGCZQ96LD1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGCZQ96LD1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGCZQ96LD1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGCZQ96LD1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGCZQ96LD1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGCZQ96LD1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGCZQ96LD1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGCZQ96LD1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGCZQ96LD1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGCZQ96LD1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGCZQ96LD1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGCZQ96LD1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGCZQ96LD1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGCZQ96LD1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGCZQ96LD1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGCZQ96LD1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGCZQ96LD1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGCZQ96LD1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGCZQ96LD1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGCZQ96LD1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGCZQ96LD1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGCZQ96LD1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGCZQ96LD1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGCZQ96LD1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGCZQ96LD1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGCZQ96LD1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGCZQ96LD1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGCZQ96LD1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGCZQ96LD1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGCZQ96LD1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGCZQ96LD1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGCZQ96LD1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGCZQ96LD1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGCZQ96LD1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGCZQ96LD1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGCZQ96LD1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGCZQ96LD1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGCZQ96LD1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGCZQ96LD1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGCZQ96LD1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGCZQ96LD1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SGCZQ96LD1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGCZQ96LD1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGCZQ96LD1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGCZQ96LD1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGCZQ96LD1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGCZQ96LD1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGCZQ96LD1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGCZQ96LD1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGCZQ96LD1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGCZQ96LD1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SGCZQ96LD1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGCZQ96LD1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGCZQ96LD1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGCZQ96LD1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGCZQ96LD1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGCZQ96LD1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGCZQ96LD1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGCZQ96LD1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGCZQ96LD1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGCZQ96LD1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGCZQ96LD1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGCZQ96LD1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGCZQ96LD1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SGCZQ96LD1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SGCZQ96LD1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGCZQ96LD1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGCZQ96LD1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGCZQ96LD1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGCZQ96LD1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGCZQ96LD1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SGCZQ96LD1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SGCZQ96LD1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms