Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
PGBD1Q96JS3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PGBD1Q96JS3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PGBD1Q96JS3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PGBD1Q96JS3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PGBD1Q96JS3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PGBD1Q96JS3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PGBD1Q96JS3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PGBD1Q96JS3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PGBD1Q96JS3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PGBD1Q96JS3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PGBD1Q96JS3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PGBD1Q96JS3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PGBD1Q96JS3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PGBD1Q96JS3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PGBD1Q96JS3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PGBD1Q96JS3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PGBD1Q96JS3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PGBD1Q96JS3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PGBD1Q96JS3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PGBD1Q96JS3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PGBD1Q96JS3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PGBD1Q96JS3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PGBD1Q96JS3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PGBD1Q96JS3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PGBD1Q96JS3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PGBD1Q96JS3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PGBD1Q96JS3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PGBD1Q96JS3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PGBD1Q96JS3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PGBD1Q96JS3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PGBD1Q96JS3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PGBD1Q96JS3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PGBD1Q96JS3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PGBD1Q96JS3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PGBD1Q96JS3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PGBD1Q96JS3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PGBD1Q96JS3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PGBD1Q96JS3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PGBD1Q96JS3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PGBD1Q96JS3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PGBD1Q96JS3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PGBD1Q96JS3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PGBD1Q96JS3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PGBD1Q96JS3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PGBD1Q96JS3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PGBD1Q96JS3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PGBD1Q96JS3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PGBD1Q96JS3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PGBD1Q96JS3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PGBD1Q96JS3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PGBD1Q96JS3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PGBD1Q96JS3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PGBD1Q96JS3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PGBD1Q96JS3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PGBD1Q96JS3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PGBD1Q96JS3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PGBD1Q96JS3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PGBD1Q96JS3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PGBD1Q96JS3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PGBD1Q96JS3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PGBD1Q96JS3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PGBD1Q96JS3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PGBD1Q96JS3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PGBD1Q96JS3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PGBD1Q96JS3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PGBD1Q96JS3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PGBD1Q96JS3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PGBD1Q96JS3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PGBD1Q96JS3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PGBD1Q96JS3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PGBD1Q96JS3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PGBD1Q96JS3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PGBD1Q96JS3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PGBD1Q96JS3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PGBD1Q96JS3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PGBD1Q96JS3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PGBD1Q96JS3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PGBD1Q96JS3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PGBD1Q96JS3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PGBD1Q96JS3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PGBD1Q96JS3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PGBD1Q96JS3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PGBD1Q96JS3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PGBD1Q96JS3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PGBD1Q96JS3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PGBD1Q96JS3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PGBD1Q96JS3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PGBD1Q96JS3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PGBD1Q96JS3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PGBD1Q96JS3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PGBD1Q96JS3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PGBD1Q96JS3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PGBD1Q96JS3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PGBD1Q96JS3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PGBD1Q96JS3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PGBD1Q96JS3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PGBD1Q96JS3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PGBD1Q96JS3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PGBD1Q96JS3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms