Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC4

ZNF479, Zinc finger protein 479, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF479Q96JC4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF479Q96JC4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF479Q96JC4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF479Q96JC4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF479Q96JC4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF479Q96JC4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF479Q96JC4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF479Q96JC4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF479Q96JC4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF479Q96JC4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF479Q96JC4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF479Q96JC4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF479Q96JC4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF479Q96JC4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF479Q96JC4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF479Q96JC4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF479Q96JC4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF479Q96JC4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF479Q96JC4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF479Q96JC4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF479Q96JC4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF479Q96JC4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ZNF479Q96JC4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF479Q96JC4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF479Q96JC4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF479Q96JC4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF479Q96JC4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF479Q96JC4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF479Q96JC4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF479Q96JC4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZNF479Q96JC4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF479Q96JC4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF479Q96JC4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF479Q96JC4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF479Q96JC4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF479Q96JC4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF479Q96JC4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZNF479Q96JC4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF479Q96JC4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF479Q96JC4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF479Q96JC4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF479Q96JC4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF479Q96JC4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF479Q96JC4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZNF479Q96JC4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF479Q96JC4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ZNF479Q96JC4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF479Q96JC4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF479Q96JC4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF479Q96JC4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF479Q96JC4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF479Q96JC4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF479Q96JC4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF479Q96JC4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF479Q96JC4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF479Q96JC4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF479Q96JC4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ZNF479Q96JC4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF479Q96JC4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF479Q96JC4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF479Q96JC4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF479Q96JC4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF479Q96JC4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF479Q96JC4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF479Q96JC4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF479Q96JC4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF479Q96JC4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF479Q96JC4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF479Q96JC4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF479Q96JC4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF479Q96JC4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF479Q96JC4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF479Q96JC4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF479Q96JC4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF479Q96JC4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF479Q96JC4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF479Q96JC4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF479Q96JC4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF479Q96JC4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF479Q96JC4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF479Q96JC4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF479Q96JC4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF479Q96JC4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF479Q96JC4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF479Q96JC4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF479Q96JC4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF479Q96JC4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF479Q96JC4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF479Q96JC4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF479Q96JC4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF479Q96JC4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF479Q96JC4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF479Q96JC4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF479Q96JC4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF479Q96JC4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF479Q96JC4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF479Q96JC4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF479Q96JC4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF479Q96JC4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF479Q96JC4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms